RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514110.5

SNHG4-208, Transcript of small nucleolar RNA host gene 4, human

TSL 1 (best)

Gene SNHG4, Length 679 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleoplasm .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG4-208	ENST00000514110	ZC3HAV1	Q7Z2W4	902 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	C6orf120	Q7Z4R8	191 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	MAPK1IP1L	Q8NDC0	245 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	KBTBD8	Q8NFY9	601 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	PIWIL2	Q8TC59	973 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	ZNF75CP	Q92670	426 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	FBXW5	Q969U6	566 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	OR5B2	Q96R09	309 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	ZNF300	Q96RE9	604 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	LAT2	Q9GZY6	243 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	ESRP2	Q9H6T0	727 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	KLHL9	Q9P2J3	617 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	MKLN1	Q9UL63	735 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	MAGED1	Q9Y5V3	778 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	NUP214	P35658	2090 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	ITM2A	O43736	263 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	TYROBP	O43914	113 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	STX11	O75558	287 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	UGT2B17	O75795	530 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	CYP7B1	O75881	506 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	CDKN1A	P38936	164 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	ETV4	P43268	484 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	SESN3	P58005	492 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	VSNL1	P62760	191 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	EMX2	Q04743	252 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	IFFO1	Q0D2I5	559 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	MAPK14	Q16539	360 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	CLEC12B	Q2HXU8	276 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	PGGHG	Q32M88	737 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	ARHGAP11B	Q3KRB8	267 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	C3orf33	Q6P1S2	294 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	BHLHB9	Q6PI77	547 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	SMAP2	Q8WU79	429 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	PKNOX2	Q96KN3	472 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	SLC35G5	Q96KT7	338 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	PPP1R36	Q96LQ0	422 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	POTEKP	Q9BYX7	375 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	TRIM2	Q9C040	744 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	ZNF350	Q9GZX5	532 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	NGB	Q9NPG2	151 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	ASIC5	Q9NY37	505 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	NOP53	Q9NZM5	478 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	RNF103-CHMP3	A0A140T963	221 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110		A0A1W2PP18	115 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	DUXA	A6NLW8	204 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	ZNF724	A8MTY0	619 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	RNF223	E7ERA6	249 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	RAMP1	O60894	148 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	BCAS1	O75363	584 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	AK1	P00568	194 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	CSTA	P01040	98 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	FES	P07332	822 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	THBS1	P07996	1170 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	UBTFL6	P0CB48	400 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	IGHV1-2	P23083	117 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	DIO1	P49895	249 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	MERTK	Q12866	999 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	FAP	Q12884	760 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	MAD2L1	Q13257	205 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	VEZF1	Q14119	521 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	PPA1	Q15181	289 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	STK11	Q15831	433 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	PDCD2	Q16342	344 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	HEPHL1	Q6MZM0	1159 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	TMPPE	Q6ZT21	453 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	ZNF781	Q8N8C0	355 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	OR4A15	Q8NGL6	344 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	MIPOL1	Q8TD10	442 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	ST8SIA1	Q92185	356 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	GTPBP3	Q969Y2	492 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	ROPN1B	Q9BZX4	212 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	OR51I1	Q9H343	314 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	AKTIP	Q9H8T0	292 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	ROPN1	Q9HAT0	212 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	LIPT1	Q9Y234	373 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	FBN1	P35555	2871 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	HIVEP2	P31629	2446 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	JMJD1C	Q15652	2540 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	WDR91	A4D1P6	747 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	RNASET2	O00584	256 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	SCN2B	O60939	215 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	NDUFS7	O75251	213 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	PGM3	O95394	542 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	CD8A	P01732	235 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	IGHV4-39	P01824	125 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	OR12D1	P0DN82	309 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	PGC	P20142	388 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	COX5A	P20674	150 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	PGM1	P36871	562 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	ACVR1B	P36896	505 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	PHC1	P78364	1004 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	FUT5	Q11128	374 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	SMU1	Q2TAY7	513 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	TYW3	Q6IPR3	259 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	DNAJC14	Q6Y2X3	702 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68

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