RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507965.5

ATXN3-210, Transcript of ataxin 3, human

TSL 2

Gene ATXN3, Length 708 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-210	ENST00000507965	MRPL46	Q9H2W6	279 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	EQTN	Q9NQ60	294 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	ZNF701	Q9NV72	531 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	FAM120C	Q9NX05	1096 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	TAS2R9	Q9NYW1	312 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	PSME2	Q9UL46	239 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	TMCO1	Q9UM00	188 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	ABCG2	Q9UNQ0	655 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	LAMP3	Q9UQV4	416 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	POLR3H	Q9Y535	204 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	TIMM22	Q9Y584	194 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	MAGED1	Q9Y5V3	778 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	MYO1G	B0I1T2	1018 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	POC1B-GALNT4	F8VUJ3	575 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	UBFD1	O14562	309 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	TNFSF11	O14788	317 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	CLOCK	O15516	846 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	IL33	O95760	270 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	ANGPTL1	O95841	491 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	IGHV4-39	P01824	125 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	KRT6A	P02538	564 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	KRT6B	P04259	564 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	INHBA	P08476	426 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	ANXA4	P09525	319 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	PF4V1	P10720	104 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	HSD3B1	P14060	373 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	ZNF17	P17021	662 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	DDC	P20711	480 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	PSMA4	P25789	261 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	CD40	P25942	277 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	GCA	P28676	217 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	ECHS1	P30084	290 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	PHB	P35232	272 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	ACVR1B	P36896	505 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	KRT6C	P48668	564 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	RPS4X	P62701	263 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	ACSM2A	Q08AH3	577 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	HSPB3	Q12988	150 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	FGFBP1	Q14512	234 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	HEPACAM	Q14CZ8	416 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	PDCD1	Q15116	288 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	RASA2	Q15283	850 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	SGCB	Q16585	318 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	DECR1	Q16698	335 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	CLEC12B	Q2HXU8	276 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	PLPPR5	Q32ZL2	321 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	SPIN4	Q56A73	249 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	ACSM2B	Q68CK6	577 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	ANKRD26P1	Q6NSI1	321 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	MFSD12	Q6NUT3	480 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	ADAM5	Q6NVV9	412 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	FRMD7	Q6ZUT3	714 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	SH2D5	Q6ZV89	423 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	EXOC3L1	Q86VI1	746 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	OR2L13	Q8N349	312 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	ZNF611	Q8N823	705 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	POC1B	Q8TC44	478 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	ABHD3	Q8WU67	409 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	GFM2	Q969S9	779 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	ERP27	Q96DN0	273 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	DTNBP1	Q96EV8	351 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	SH3YL1	Q96HL8	342 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	AJUBA	Q96IF1	538 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	GMPPA	Q96IJ6	420 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	RNF145	Q96MT1	663 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	AMDHD1	Q96NU7	426 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	BBS4	Q96RK4	519 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	ZNF382	Q96SR6	550 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	MRPL57	Q9BQC6	102 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	LMF2	Q9BU23	707 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	FUT8	Q9BYC5	575 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	SRXN1	Q9BYN0	137 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	PRRG4	Q9BZD6	226 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	TBL1XR1	Q9BZK7	514 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	GLIPR2	Q9H4G4	154 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	GSTO2	Q9H4Y5	243 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	PTGES2	Q9H7Z7	377 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965		Q9N2J8	555 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	MIEF1	Q9NQG6	463 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	GIMAP4	Q9NUV9	329 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	DDX18	Q9NVP1	670 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	FBXO34	Q9NWN3	711 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	MKS1	Q9NXB0	559 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	TMEM216	Q9P0N5	145 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	C19orf53	Q9UNZ5	99 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	PTGDR2	Q9Y5Y4	395 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	AP4B1	Q9Y6B7	739 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	ATP23	Q9Y6H3	246 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	HIVEP2	P31629	2446 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965		A0A087WV62	115 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	IGLV3-32	A0A0A0MS00	114 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965		A0A0J9YW62	118 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965		A0A1W2PRB8	838 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	RNF212B	A8MTL3	300 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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