RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497368.1

UBE3C-208, Transcript of ubiquitin protein ligase E3C, human

TSL 2

Gene UBE3C, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBE3C-208	ENST00000497368	TRIM64B	A6NI03	449 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	SMIM23	A6NLE4	172 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368		H3BML4	177 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	AZIN1	O14977	448 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	SCAMP2	O15127	329 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	GSTA4	O15217	222 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	EMC8	O43402	210 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	AKAP10	O43572	662 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	SCN2B	O60939	215 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	GCM2	O75603	506 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	BCAS2	O75934	225 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	SOX30	O94993	753 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	GOSR1	O95249	250 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	H6PD	O95479	791 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	OPN1LW	P04000	364 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	UROS	P10746	265 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	LAMP1	P11279	417 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	ZNF17	P17021	662 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	DNASE1	P24855	282 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	AGTR1	P30556	359 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	CD79B	P40259	229 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	GSTM5	P46439	218 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	VSNL1	P62760	191 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	PHC1	P78364	1004 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	RCAN2	Q14206	197 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	PON3	Q15166	354 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	TSC22D1	Q15714	1073 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	ZNF239	Q16600	458 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	SPATS1	Q496A3	300 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368		Q5PR19	223 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	LGSN	Q5TDP6	509 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	RAET1L	Q5VY80	246 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	ENPP6	Q6UWR7	440 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	STAC2	Q6ZMT1	411 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	GTPBP8	Q8N3Z3	284 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	KRTCAP2	Q8N6L1	136 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	ZNF610	Q8N9Z0	462 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	OR7A2P	Q8NGA2	310 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	OR4K17	Q8NGC6	315 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	OR10D3	Q8NH80	312 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	PSMA8	Q8TAA3	256 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	AEN	Q8WTP8	325 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	DUSP19	Q8WTR2	217 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	TWIST2	Q8WVJ9	160 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	SLC9A6	Q92581	669 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	CDS1	Q92903	461 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	TMCO6	Q96DC7	493 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	RNF145	Q96MT1	663 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	MS4A4E	Q96PG1	132 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	BBS4	Q96RK4	519 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	C1orf50	Q9BV19	199 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	PINK1	Q9BXM7	581 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	C20orf27	Q9GZN8	174 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	TSPYL1	Q9H0U9	437 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	PIGM	Q9H3S5	423 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	REEP4	Q9H6H4	257 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	TMEM185B	Q9H7F4	350 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	MED17	Q9NVC6	651 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	DDX18	Q9NVP1	670 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	C1orf109	Q9NX04	203 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	TAS2R9	Q9NYW1	312 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	LGALS13	Q9UHV8	139 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	ATP6V1H	Q9UI12	483 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	ICAM5	Q9UMF0	924 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	VDAC3	Q9Y277	283 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	STK38L	Q9Y2H1	464 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	FIS1	Q9Y3D6	152 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	ZNF175	Q9Y473	711 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368		A0A096LNT2	108 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368		A0A1W2PQD3	144 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	SCD	O00767	359 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	TNFSF11	O14788	317 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	ANKRD28	O15084	1053 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	ADAMDEC1	O15204	470 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	ITM2A	O43736	263 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	TYROBP	O43914	113 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	CXCL13	O43927	109 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	SPAG7	O75391	227 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	LYPLA1	O75608	230 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	LY6G6D	O95868	133 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	HMGN2	P05204	90 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	CRH	P06850	196 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	NUDT17	P0C025	328 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	LINC00032	P0C843	101 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	PRPS2	P11908	318 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	PEPD	P12955	493 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	CPA3	P15088	417 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	PAX1	P15863	534 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	KRT4	P19013	534 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	TBXA2R	P21731	343 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	NTS	P30990	170 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	GABRA3	P34903	492 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	PEX19	P40855	299 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	RFX3	P48380	749 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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