RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496574.6

PKD1-222, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, human

TSL 5

Gene PKD1, Length 4,419 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKD1-222	ENST00000496574	TUBG1	P23258	451 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	PER3	P56645	1201 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	HERV-K104	P61576	105 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	C6orf132	Q5T0Z8	1188 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	ACOT4	Q8N9L9	421 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	MYLIP	Q8WY64	445 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	GGT3P	A6NGU5	568 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	SSX4	O60224	188 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	SRPX2	O60687	465 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	PRSS23	O95084	383 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	TRIM23	P36406	574 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	TEAD2	Q15562	447 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	AVPI1	Q5T686	147 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	SLC6A19	Q695T7	634 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	CDRT4	Q8N9R6	151 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	OR13C3	Q8NGS6	347 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	CHTF18	Q8WVB6	975 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	KLHL15	Q96M94	604 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	OR7D2	Q96RA2	312 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	A4GALT	Q9NPC4	353 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	DOCK2	Q92608	1830 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	TMEM82	A0PJX8	343 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	FUT1	P19526	365 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	SOX9	P48436	509 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	SIRPA	P78324	504 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	TPBG	Q13641	420 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	AANAT	Q16613	207 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	C14orf28	Q4W4Y0	310 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	CALHM3	Q86XJ0	350 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	RDH10	Q8IZV5	341 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	ACBD4	Q8NC06	268 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	DEFB118	Q96PH6	123 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	MVB12B	Q9H7P6	319 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	CDHR4	A6H8M9	788 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	HCRTR2	O43614	444 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	FABP5	Q01469	135 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	ACSM5	Q6NUN0	579 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	RBM45	Q8IUH3	476 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	CDC6	Q99741	560 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	MYEF2	Q9P2K5	600 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF281	Q9Y2X9	895 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	GPR89A	B7ZAQ6	455 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	CLEC3A	O75596	197 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	TPO	P07202	933 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	GPR89B	P0CG08	455 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	CSNK1D	P48730	415 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	MEF2D	Q14814	521 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	PUS10	Q3MIT2	529 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	TMUB2	Q71RG4	321 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	PRSS45	Q7RTY3	260 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	VRK3	Q8IV63	474 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	LMNTD1	Q8N9Z9	388 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	MICU1	Q9BPX6	476 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	MAN2C1	Q9NTJ4	1040 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	P2RX6	O15547	441 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	CA12	O43570	354 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF254	O75437	659 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	INHBB	P09529	407 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	TAS2R31	P59538	309 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	PFN3	P60673	137 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	PRPS1	P60891	318 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	TRA2B	P62995	288 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	IFITM3	Q01628	133 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	SLC35F3	Q8IY50	421 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	BPIFB2	Q8N4F0	458 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF740	Q8NDX6	193 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	OR14K1	Q8NGZ2	314 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	SFXN5	Q8TD22	340 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	LINC01599	Q8WXQ3	324 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	DNAJA3	Q96EY1	480 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	SIRT5	Q9NXA8	310 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	ALS2	Q96Q42	1657 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574		A8MVJ9	347 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	UPK1A	O00322	258 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	B4GALT3	O60512	393 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	RAD1	O60671	282 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	EIF2S3	P41091	472 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	CTBS	Q01459	385 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	TMEM25	Q86YD3	366 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF619	Q8N2I2	560 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF565	Q8N9K5	539 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	CDS1	Q92903	461 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	PDXP	Q96GD0	296 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	SEC22A	Q96IW7	307 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	DSCR3	O14972	297 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	KIAA0355	O15063	1070 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	GJA5	P36382	358 aa		13.22	□□□□□ -0.29

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