RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486268.5

ERGIC3-215, Transcript of ERGIC and golgi 3, human

TSL 2

Gene ERGIC3, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERGIC3-215	ENST00000486268	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	SCN2A	Q99250	2005 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	USP24	Q9UPU5	2620 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268		A0A087WUJ7	227 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	LOC102723996	A0A087X1L8	192 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268		H3BSA7	217 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	BCAS1	O75363	584 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	CDK1	P06493	297 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	CCL4	P13236	92 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	IFI30	P13284	250 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	DCK	P27707	260 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	SLC9A3	P48764	834 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	TMBIM6	P55061	237 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	EFNB1	P98172	346 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	EMX1	Q04741	257 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	SKP2	Q13309	424 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	EIF3I	Q13347	325 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	SYT6	Q5T7P8	510 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	RNLS	Q5VYX0	342 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	TMEM236	Q5W0B7	351 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	GTF2IRD2B	Q6EKJ0	949 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	PAPD4	Q6PIY7	484 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	B3GNT6	Q6ZMB0	384 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	NUP54	Q7Z3B4	507 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	GTF2IRD2	Q86UP8	949 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	KIF18B	Q86Y91	864 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	SLC15A4	Q8N697	577 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	APCDD1L	Q8NCL9	501 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	OR2T33	Q8NG76	320 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	OR52L1	Q8NGH7	329 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	PHOSPHO1	Q8TCT1	267 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	GGH	Q92820	318 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	MR1	Q95460	341 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	UBE2F	Q969M7	185 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	PMEPA1	Q969W9	287 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	BPIFA2	Q96DR5	249 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	OMA1	Q96E52	524 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	CRELD1	Q96HD1	420 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	ADO	Q96SZ5	270 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	DOK1	Q99704	481 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	DDA1	Q9BW61	102 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	ULBP3	Q9BZM4	244 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	CCDC90B	Q9GZT6	254 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	CNIH4	Q9P003	139 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	ERVK-18	Q9QC07	812 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	ICAM5	Q9UMF0	924 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	LOXL2	Q9Y4K0	774 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	PCDHGB6	Q9Y5F9	930 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	EFCAB9	A8MZ26	197 aa		10.81	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	HCN1	O60741	890 aa		10.81	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	TRMU	O75648	421 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	ZFAND5	O76080	213 aa		10.81	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	ATXN8OS	P0DMR3	200 aa		10.81	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	BMP7	P18075	431 aa		10.81	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	ABCD3	P28288	659 aa		10.81	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	GSTT1	P30711	240 aa		10.81	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	GRK5	P34947	590 aa		10.81	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	SLC15A1	P46059	708 aa		10.81	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	TMED10	P49755	219 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	SLC26A5	P58743	744 aa		10.81	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	NCF4	Q15080	339 aa		10.81	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	SNAPC1	Q16533	368 aa		10.81	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	ANKDD1A	Q495B1	522 aa		10.81	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	C3orf38	Q5JPI3	329 aa		10.81	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	UBE2U	Q5VVX9	321 aa		10.81	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	FAAH2	Q6GMR7	532 aa		10.81	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	FAM198B	Q6UWH4	519 aa		10.81	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	SHISA6	Q6ZSJ9	500 aa		10.81	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	AHSA2	Q719I0	299 aa		10.81	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	RAB11FIP2	Q7L804	512 aa		10.81	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	NLGN4X	Q8N0W4	816 aa		10.81	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	STX19	Q8N4C7	294 aa		10.81	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	TMEM163	Q8TC26	289 aa		10.81	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	GRHL3	Q8TE85	626 aa		10.81	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	TTC9	Q92623	222 aa		10.81	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	TMIGD2	Q96BF3	282 aa		10.81	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	TMCO6	Q96DC7	493 aa		10.81	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	TAAR9	Q96RI9	348 aa		10.81	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	TSC22D3	Q99576	134 aa		10.81	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	TSSK6	Q9BXA6	273 aa		10.81	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	CDCA4	Q9BXL8	241 aa		10.81	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	TBL1XR1	Q9BZK7	514 aa		10.81	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	RACGAP1	Q9H0H5	632 aa		10.81	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	TVP23B	Q9NYZ1	205 aa		10.81	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	MSRB2	Q9Y3D2	182 aa		10.81	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	NPFFR2	Q9Y5X5	522 aa		10.81	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	SDK2	Q58EX2	2172 aa		10.81	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	FER1L5	A0AVI2	2057 aa		10.81	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268		A0A1W2PQ72	361 aa		10.8	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	TRABD2B	A6NFA1	517 aa		10.8	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	PLD2	O14939	933 aa		10.8	□□□□□ -0.68
ERGIC3-215	ENST00000486268	NDUFB5	O43674	189 aa		10.8	□□□□□ -0.68

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