RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482419.1

FAM208B-208, Transcript of family with sequence similarity 208 member B, human

TSL 2

Gene FAM208B, Length 424 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM208B-208	ENST00000482419	MAD1L1	Q9Y6D9	718 aa		2.59	□□□□□ -1.99
FAM208B-208	ENST00000482419	ARHGAP21	Q5T5U3	1957 aa		2.59	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	LTBP1	Q14766	1721 aa		2.59	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419		G3V4G9	280 aa		2.58	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419		K7ENP7	123 aa		2.58	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	MAGEB3	O15480	346 aa		2.58	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	TBL1X	O60907	577 aa		2.58	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	IGHD	P01880	384 aa		2.58	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	HOXC4	P09017	264 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	DHPS	P49366	369 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	GBX2	P52951	348 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	MRPS11	P82912	194 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	VLDLR	P98155	873 aa		2.58	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	MAJIN	Q3KP22	176 aa		2.58	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	PMF1	Q6P1K2	205 aa		2.58	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	CASC1	Q6TDU7	716 aa		2.58	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	PPP1R27	Q86WC6	154 aa		2.58	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	SERPINA9	Q86WD7	417 aa		2.58	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		2.58	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	NEIL2	Q969S2	332 aa		2.58	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	SENP8	Q96LD8	212 aa		2.58	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	C12orf66	Q96MD2	445 aa		2.58	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	SMIM14	Q96QK8	99 aa		2.58	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		2.58	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	SLC6A7	Q99884	636 aa		2.58	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	SLC30A2	Q9BRI3	323 aa		2.58	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	EDEM2	Q9BV94	578 aa		2.58	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	POLR1E	Q9GZS1	481 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	ONECUT1	Q9UBC0	465 aa		2.58	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	RNF14	Q9UBS8	474 aa		2.58	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	LCMT1	Q9UIC8	334 aa		2.58	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	WDR45	Q9Y484	360 aa		2.58	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	ALG6	Q9Y672	507 aa		2.58	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	RIPK2	O43353	540 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	GPX5	O75715	221 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	ADCY5	O95622	1261 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	PGC	P20142	388 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	TPSB2	P20231	275 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	TBXA2R	P21731	343 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	PCMT1	P22061	227 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	GLRA2	P23416	452 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	GABRR1	P24046	479 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	ADORA2B	P29275	332 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	STAR	P49675	285 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	UCN	P55089	124 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	ACTR1A	P61163	376 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	UBE2H	P62256	183 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	SPIB	Q01892	262 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	TPSAB1	Q15661	275 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	SYPL1	Q16563	259 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	TATDN3	Q17R31	274 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	SLC5A12	Q1EHB4	618 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	LRRC36	Q1X8D7	754 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	TMEM110	Q86TL2	294 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	C17orf82	Q86X59	251 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	TMEM123	Q8N131	208 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	ANKFN1	Q8N957	763 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	OR2A12	Q8NGT7	310 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	FBXO30	Q8TB52	745 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	ANKRD49	Q8WVL7	239 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	FAM3C	Q92520	227 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	SH3YL1	Q96HL8	342 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	OR5B2	Q96R09	309 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	DUSP16	Q9BY84	665 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	CAB39L	Q9H9S4	337 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	SLC17A5	Q9NRA2	495 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	OR1A1	Q9P1Q5	309 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	PTBP2	Q9UKA9	531 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	OARD1	Q9Y530	152 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	USP16	Q9Y5T5	823 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	KIF16B	Q96L93	1317 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	KDR	P35968	1356 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	TRIM49D1	C9J1S8	452 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	MMP23A	O75900	390 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	LRAT	O95237	230 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	TIMP1	P01033	207 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	PDHB	P11177	359 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	VDAC1	P21796	283 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	CALB2	P22676	271 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	OTX2	P32243	289 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	IL24	Q13007	206 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	CHIT1	Q13231	466 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	LAGE3	Q14657	143 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	AANAT	Q16613	207 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	NDUFA9	Q16795	377 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	TIGIT	Q495A1	244 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	EOGT	Q5NDL2	527 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	KDELC1	Q6UW63	502 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM208B-208	ENST00000482419	ZNF100	Q8IYN0	542 aa		2.56	□□□□□ -2

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