RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480486.1

CHAF1B-202, Transcript of chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

TSL 3

Gene CHAF1B, Length 1,152 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1B-202ENST00000480486 SESN3P58005 492 aa9.96□□□□□ -0.82
CHAF1B-202ENST00000480486 TNFRSF17Q02223 184 aa9.96□□□□□ -0.82
CHAF1B-202ENST00000480486 RBBP4Q09028 425 aa9.96□□□□□ -0.82
CHAF1B-202ENST00000480486 DUSP8Q13202 625 aa9.96□□□□□ -0.82
CHAF1B-202ENST00000480486 RGNQ15493 299 aa9.96□□□□□ -0.82
CHAF1B-202ENST00000480486 SPDYE7PQ495Y7 208 aa9.96□□□□□ -0.82
CHAF1B-202ENST00000480486 NHSL2Q5HYW2 709 aa9.96□□□□□ -0.82
CHAF1B-202ENST00000480486 PRAMEF20Q5VT98 475 aa9.96□□□□□ -0.82
CHAF1B-202ENST00000480486 OR52E8Q6IFG1 317 aa9.96□□□□□ -0.82
CHAF1B-202ENST00000480486 BHLHB9Q6PI77 547 aa9.96□□□□□ -0.82
CHAF1B-202ENST00000480486 LRFN4Q6PJG9 635 aa9.96□□□□□ -0.82
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CHAF1B-202ENST00000480486 C9orf40Q8IXQ3 194 aa9.96□□□□□ -0.82
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CHAF1B-202ENST00000480486 C7orf57Q8NEG2 295 aa9.96□□□□□ -0.82
CHAF1B-202ENST00000480486 PSMA8Q8TAA3 256 aa9.96□□□□□ -0.82
CHAF1B-202ENST00000480486 FIG4Q92562 907 aa9.96□□□□□ -0.82
CHAF1B-202ENST00000480486 PIGTQ969N2 578 aa9.96□□□□□ -0.82
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CHAF1B-202ENST00000480486 MOAP1Q96BY2 351 aa9.96□□□□□ -0.82
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CHAF1B-202ENST00000480486 TIMP4Q99727 224 aa9.96□□□□□ -0.82
CHAF1B-202ENST00000480486 ARMC1Q9NVT9 282 aa9.96□□□□□ -0.82
CHAF1B-202ENST00000480486 CES1P1Q9UKY3 287 aa9.96□□□□□ -0.82
CHAF1B-202ENST00000480486 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
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CHAF1B-202ENST00000480486 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa9.95□□□□□ -0.82
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CHAF1B-202ENST00000480486 PGRMC2O15173 223 aa9.95□□□□□ -0.82
CHAF1B-202ENST00000480486 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
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CHAF1B-202ENST00000480486 ALX3O95076 343 aa9.95□□□□□ -0.82
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CHAF1B-202ENST00000480486 NCK1P16333 377 aa9.95□□□□□ -0.82
CHAF1B-202ENST00000480486 CRATP43155 626 aa9.95□□□□□ -0.82
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CHAF1B-202ENST00000480486 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP9.95□□□□□ -0.82
CHAF1B-202ENST00000480486 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
CHAF1B-202ENST00000480486 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
CHAF1B-202ENST00000480486 STX4Q12846 297 aa9.95□□□□□ -0.82
CHAF1B-202ENST00000480486 GAB1Q13480 694 aa9.95□□□□□ -0.82
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CHAF1B-202ENST00000480486 C18orf63Q68DL7 685 aa9.95□□□□□ -0.82
CHAF1B-202ENST00000480486 VASNQ6EMK4 673 aa9.95□□□□□ -0.82
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CHAF1B-202ENST00000480486 C11orf65Q8NCR3 313 aa9.95□□□□□ -0.82
CHAF1B-202ENST00000480486 OR10G3Q8NGC4 313 aa9.95□□□□□ -0.82
CHAF1B-202ENST00000480486 OR4K14Q8NGD5 310 aa9.95□□□□□ -0.82
CHAF1B-202ENST00000480486 SFXN5Q8TD22 340 aa9.95□□□□□ -0.82
CHAF1B-202ENST00000480486 CANT1Q8WVQ1 401 aa9.95□□□□□ -0.82
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CHAF1B-202ENST00000480486 CXorf36Q9H7Y0 433 aa9.95□□□□□ -0.82
CHAF1B-202ENST00000480486 YY1AP1Q9H869 796 aa9.95□□□□□ -0.82
CHAF1B-202ENST00000480486 CALHM2Q9HA72 323 aa9.95□□□□□ -0.82
CHAF1B-202ENST00000480486 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
CHAF1B-202ENST00000480486 USP22Q9UPT9 525 aa9.95□□□□□ -0.82
CHAF1B-202ENST00000480486 ABCA1O95477 2261 aa9.94□□□□□ -0.82
CHAF1B-202ENST00000480486 TCRBV5S2A0A599 114 aa9.94□□□□□ -0.82
CHAF1B-202ENST00000480486 GLOD5A6NK44 160 aa9.94□□□□□ -0.82
CHAF1B-202ENST00000480486 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
CHAF1B-202ENST00000480486 TMPRSS2O15393 492 aa9.94□□□□□ -0.82
CHAF1B-202ENST00000480486 HPNP05981 417 aa9.94□□□□□ -0.82
CHAF1B-202ENST00000480486 BMP7P18075 431 aa9.94□□□□□ -0.82
CHAF1B-202ENST00000480486 TNNI3P19429 210 aa9.94□□□□□ -0.82
CHAF1B-202ENST00000480486 GDF1P27539 372 aa9.94□□□□□ -0.82
CHAF1B-202ENST00000480486 PCGF2P35227 344 aa9.94□□□□□ -0.82
CHAF1B-202ENST00000480486 CCT3P49368 545 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
CHAF1B-202ENST00000480486 PRIM2P49643 509 aa9.94□□□□□ -0.82
CHAF1B-202ENST00000480486 CDK9P50750 372 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
CHAF1B-202ENST00000480486 HSPB3Q12988 150 aa9.94□□□□□ -0.82
CHAF1B-202ENST00000480486 NTRK2Q16620 822 aa9.94□□□□□ -0.82
CHAF1B-202ENST00000480486 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
CHAF1B-202ENST00000480486 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
CHAF1B-202ENST00000480486 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP9.94□□□□□ -0.82
CHAF1B-202ENST00000480486 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
CHAF1B-202ENST00000480486 SAXO2Q658L1 398 aa9.94□□□□□ -0.82
CHAF1B-202ENST00000480486 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa9.94□□□□□ -0.82
CHAF1B-202ENST00000480486 Q6ZS46 218 aa9.94□□□□□ -0.82
CHAF1B-202ENST00000480486 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
CHAF1B-202ENST00000480486 REC114Q7Z4M0 266 aa9.94□□□□□ -0.82
CHAF1B-202ENST00000480486 ADGRG5Q8IZF4 528 aa9.94□□□□□ -0.82
CHAF1B-202ENST00000480486 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
CHAF1B-202ENST00000480486 OR56A1Q8NGH5 318 aa9.94□□□□□ -0.82
CHAF1B-202ENST00000480486 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
CHAF1B-202ENST00000480486 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
CHAF1B-202ENST00000480486 PLPPR2Q96GM1 343 aa9.94□□□□□ -0.82
CHAF1B-202ENST00000480486 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
CHAF1B-202ENST00000480486 FBXL20Q96IG2 436 aa9.94□□□□□ -0.82
CHAF1B-202ENST00000480486 ZFP3Q96NJ6 502 aa9.94□□□□□ -0.82
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