RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464518.1

SLC13A3-208, Transcript of solute carrier family 13 member 3, human

TSL 5

Gene SLC13A3, Length 792 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC13A3-208	ENST00000464518	CPNE4	Q96A23	557 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
SLC13A3-208	ENST00000464518	PPP1R36	Q96LQ0	422 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SLC13A3-208	ENST00000464518	CDK15	Q96Q40	435 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SLC13A3-208	ENST00000464518	TBL1XR1	Q9BZK7	514 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SLC13A3-208	ENST00000464518	MMADHC	Q9H3L0	296 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
SLC13A3-208	ENST00000464518	TNFRSF12A	Q9NP84	129 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SLC13A3-208	ENST00000464518	MID1IP1	Q9NPA3	183 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SLC13A3-208	ENST00000464518	PFDN4	Q9NQP4	134 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SLC13A3-208	ENST00000464518	MCM8	Q9UJA3	840 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SLC13A3-208	ENST00000464518	MGAT4B	Q9UQ53	548 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SLC13A3-208	ENST00000464518	FIS1	Q9Y3D6	152 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SLC13A3-208	ENST00000464518	NBEAL1	Q6ZS30	2694 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SLC13A3-208	ENST00000464518	DPRX	A6NFQ7	191 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SLC13A3-208	ENST00000464518	SHISA9	B4DS77	424 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SLC13A3-208	ENST00000464518	CXCL13	O43927	109 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SLC13A3-208	ENST00000464518	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
SLC13A3-208	ENST00000464518	CRCP	O75575	148 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SLC13A3-208	ENST00000464518	TSPAN8	P19075	237 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SLC13A3-208	ENST00000464518	ME2	P23368	584 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SLC13A3-208	ENST00000464518	PGM1	P36871	562 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SLC13A3-208	ENST00000464518	CDH11	P55287	796 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SLC13A3-208	ENST00000464518	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
SLC13A3-208	ENST00000464518	GUCA2A	Q02747	115 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SLC13A3-208	ENST00000464518	TRAF3	Q13114	568 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SLC13A3-208	ENST00000464518	STX5	Q13190	355 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SLC13A3-208	ENST00000464518	RAB35	Q15286	201 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SLC13A3-208	ENST00000464518	ZNF239	Q16600	458 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
SLC13A3-208	ENST00000464518	MFSD12	Q6NUT3	480 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SLC13A3-208	ENST00000464518		Q6ZT83	130 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SLC13A3-208	ENST00000464518	MEX3D	Q86XN8	651 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
SLC13A3-208	ENST00000464518	RFLNB	Q8N5W9	214 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SLC13A3-208	ENST00000464518	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
SLC13A3-208	ENST00000464518	REXO5	Q96IC2	774 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
SLC13A3-208	ENST00000464518	ZNF385D	Q9H6B1	395 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SLC13A3-208	ENST00000464518	C12orf49	Q9H741	205 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SLC13A3-208	ENST00000464518	ANKRA2	Q9H9E1	313 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SLC13A3-208	ENST00000464518	C3orf14	Q9HBI5	128 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SLC13A3-208	ENST00000464518	TIGAR	Q9NQ88	270 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SLC13A3-208	ENST00000464518	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SLC13A3-208	ENST00000464518	BAIAP2L1	Q9UHR4	511 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SLC13A3-208	ENST00000464518	PCTP	Q9UKL6	214 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SLC13A3-208	ENST00000464518	SNX6	Q9UNH7	406 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SLC13A3-208	ENST00000464518	UBD	O15205	165 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SLC13A3-208	ENST00000464518	PSMG1	O95456	288 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SLC13A3-208	ENST00000464518	ANGPTL1	O95841	491 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SLC13A3-208	ENST00000464518	OTC	P00480	354 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SLC13A3-208	ENST00000464518	JUN	P05412	331 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SLC13A3-208	ENST00000464518	NGFR	P08138	427 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SLC13A3-208	ENST00000464518	BMP4	P12644	408 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SLC13A3-208	ENST00000464518	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SLC13A3-208	ENST00000464518	USF1	P22415	310 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SLC13A3-208	ENST00000464518	IGFBP5	P24593	272 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SLC13A3-208	ENST00000464518	PSMA4	P25789	261 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SLC13A3-208	ENST00000464518	ELK4	P28324	431 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SLC13A3-208	ENST00000464518	TTK	P33981	857 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SLC13A3-208	ENST00000464518	PKNOX1	P55347	436 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SLC13A3-208	ENST00000464518	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SLC13A3-208	ENST00000464518	PPA1	Q15181	289 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SLC13A3-208	ENST00000464518	ZNHIT3	Q15649	155 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SLC13A3-208	ENST00000464518	UGT3A2	Q3SY77	523 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SLC13A3-208	ENST00000464518	TIMM23B	Q5SRD1	257 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SLC13A3-208	ENST00000464518	KANK2	Q63ZY3	851 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SLC13A3-208	ENST00000464518	HBM	Q6B0K9	141 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SLC13A3-208	ENST00000464518	CLEC6A	Q6EIG7	209 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SLC13A3-208	ENST00000464518	SLC43A2	Q8N370	569 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SLC13A3-208	ENST00000464518	POU5F2	Q8N7G0	328 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SLC13A3-208	ENST00000464518	OR7G2	Q8NG99	324 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SLC13A3-208	ENST00000464518	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SLC13A3-208	ENST00000464518	C10orf105	Q8TEF2	133 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SLC13A3-208	ENST00000464518	SELENOM	Q8WWX9	145 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SLC13A3-208	ENST00000464518	KAT2A	Q92830	837 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SLC13A3-208	ENST00000464518	HPS1	Q92902	700 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SLC13A3-208	ENST00000464518	MUCL1	Q96DR8	90 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SLC13A3-208	ENST00000464518	NSUN5	Q96P11	429 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SLC13A3-208	ENST00000464518	CACNG6	Q9BXT2	260 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SLC13A3-208	ENST00000464518	RTN4R	Q9BZR6	473 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SLC13A3-208	ENST00000464518	SLC35C2	Q9NQQ7	365 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SLC13A3-208	ENST00000464518	VPS29	Q9UBQ0	182 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SLC13A3-208	ENST00000464518	ALG1L2	C9J202	215 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SLC13A3-208	ENST00000464518	NDUFS8	O00217	210 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SLC13A3-208	ENST00000464518	TNFSF11	O14788	317 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SLC13A3-208	ENST00000464518	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
SLC13A3-208	ENST00000464518	CIB2	O75838	187 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SLC13A3-208	ENST00000464518	KCNH1	O95259	989 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SLC13A3-208	ENST00000464518	ESRRB	O95718	433 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SLC13A3-208	ENST00000464518	CHEK2	O96017	543 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SLC13A3-208	ENST00000464518	UROS	P10746	265 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SLC13A3-208	ENST00000464518	ATP4B	P51164	291 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SLC13A3-208	ENST00000464518	CSTF3	Q12996	717 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
SLC13A3-208	ENST00000464518	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
SLC13A3-208	ENST00000464518	PLPPR5	Q32ZL2	321 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SLC13A3-208	ENST00000464518	FAM120AOS	Q5T036	256 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SLC13A3-208	ENST00000464518	CPTP	Q5TA50	214 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SLC13A3-208	ENST00000464518	ALKBH2	Q6NS38	261 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SLC13A3-208	ENST00000464518	FAM180B	Q6P0A1	224 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SLC13A3-208	ENST00000464518	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SLC13A3-208	ENST00000464518	GPRIN3	Q6ZVF9	776 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SLC13A3-208	ENST00000464518	BHLHA15	Q7RTS1	189 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
SLC13A3-208	ENST00000464518	MARCH3	Q86UD3	253 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SLC13A3-208	ENST00000464518	MISP	Q8IVT2	679 aa		11.19	□□□□□ -0.62

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