RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462335.1

PKP4-208, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 4

Gene PKP4, Length 561 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-208ENST00000462335 CLEC18AA5D8T8 446 aa8.63□□□□□ -1.03
PKP4-208ENST00000462335 WIPF3A6NGB9 483 aa8.63□□□□□ -1.03
PKP4-208ENST00000462335 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa8.63□□□□□ -1.03
PKP4-208ENST00000462335 ADAM10O14672 748 aa8.63□□□□□ -1.03
PKP4-208ENST00000462335 TNFSF11O14788 317 aa8.63□□□□□ -1.03
PKP4-208ENST00000462335 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PKP4-208ENST00000462335 OIP5O43482 229 aa8.63□□□□□ -1.03
PKP4-208ENST00000462335 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP8.63□□□□□ -1.03
PKP4-208ENST00000462335 GKN3PP0CG01 181 aa8.63□□□□□ -1.03
PKP4-208ENST00000462335 ARAFP10398 606 aa8.63□□□□□ -1.03
PKP4-208ENST00000462335 BMP2P12643 396 aa8.63□□□□□ -1.03
PKP4-208ENST00000462335 COX6B1P14854 86 aa8.63□□□□□ -1.03
PKP4-208ENST00000462335 PRKCAP17252 672 aa8.63□□□□□ -1.03
PKP4-208ENST00000462335 UQCRC1P31930 480 aa8.63□□□□□ -1.03
PKP4-208ENST00000462335 NUDT2P50583 147 aa8.63□□□□□ -1.03
PKP4-208ENST00000462335 MNAT1P51948 309 aa8.63□□□□□ -1.03
PKP4-208ENST00000462335 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PKP4-208ENST00000462335 CLDN18P56856 261 aa8.63□□□□□ -1.03
PKP4-208ENST00000462335 CLDN20P56880 219 aa8.63□□□□□ -1.03
PKP4-208ENST00000462335 B3GALT5-AS1P59052 145 aa8.63□□□□□ -1.03
PKP4-208ENST00000462335 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PKP4-208ENST00000462335 ADORA2A-AS1P86434 159 aa8.63□□□□□ -1.03
PKP4-208ENST00000462335 FUT5Q11128 374 aa8.63□□□□□ -1.03
PKP4-208ENST00000462335 PON3Q15166 354 aa8.63□□□□□ -1.03
PKP4-208ENST00000462335 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa8.63□□□□□ -1.03
PKP4-208ENST00000462335 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PKP4-208ENST00000462335 WBP2NLQ6ICG8 309 aa8.63□□□□□ -1.03
PKP4-208ENST00000462335 NANOGP8Q6NSW7 305 aa8.63□□□□□ -1.03
PKP4-208ENST00000462335 C3orf33Q6P1S2 294 aa8.63□□□□□ -1.03
PKP4-208ENST00000462335 ERICH5Q6P6B1 374 aa8.63□□□□□ -1.03
PKP4-208ENST00000462335 CLEC18BQ6UXF7 455 aa8.63□□□□□ -1.03
PKP4-208ENST00000462335 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PKP4-208ENST00000462335 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PKP4-208ENST00000462335 SERPINA11Q86U17 422 aa8.63□□□□□ -1.03
PKP4-208ENST00000462335 RETREG3Q86VR2 466 aa8.63□□□□□ -1.03
PKP4-208ENST00000462335 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PKP4-208ENST00000462335 CLEC18CQ8NCF0 446 aa8.63□□□□□ -1.03
PKP4-208ENST00000462335 CCDC197Q8NCU1 140 aa8.63□□□□□ -1.03
PKP4-208ENST00000462335 TNIP2Q8NFZ5 429 aa8.63□□□□□ -1.03
PKP4-208ENST00000462335 OR8J3Q8NGG0 315 aa8.63□□□□□ -1.03
PKP4-208ENST00000462335 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PKP4-208ENST00000462335 RASSF5Q8WWW0 418 aa8.63□□□□□ -1.03
PKP4-208ENST00000462335 DDIT4LQ96D03 193 aa8.63□□□□□ -1.03
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PKP4-208ENST00000462335 OR5B2Q96R09 309 aa8.63□□□□□ -1.03
PKP4-208ENST00000462335 CCT8L2Q96SF2 557 aa8.63□□□□□ -1.03
PKP4-208ENST00000462335 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PKP4-208ENST00000462335 EVA1AQ9H8M9 152 aa8.63□□□□□ -1.03
PKP4-208ENST00000462335 NANOGQ9H9S0 305 aa8.63□□□□□ -1.03
PKP4-208ENST00000462335 TMEM27Q9HBJ8 222 aa8.63□□□□□ -1.03
PKP4-208ENST00000462335 SLC52A3Q9NQ40 469 aa8.63□□□□□ -1.03
PKP4-208ENST00000462335 RLIMQ9NVW2 624 aa8.63□□□□□ -1.03
PKP4-208ENST00000462335 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PKP4-208ENST00000462335 Q9UFV3 132 aa8.63□□□□□ -1.03
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PKP4-208ENST00000462335 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
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PKP4-208ENST00000462335 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
PKP4-208ENST00000462335 CLDN24A6NM45 220 aa8.62□□□□□ -1.03
PKP4-208ENST00000462335 SULT2B1O00204 365 aa8.62□□□□□ -1.03
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PKP4-208ENST00000462335 RCBTB2O95199 551 aa8.62□□□□□ -1.03
PKP4-208ENST00000462335 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
PKP4-208ENST00000462335 PRKAR1BP31321 381 aa8.62□□□□□ -1.03
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PKP4-208ENST00000462335 SLC1A3P43003 542 aa8.62□□□□□ -1.03
PKP4-208ENST00000462335 KCNJ5P48544 419 aa8.62□□□□□ -1.03
PKP4-208ENST00000462335 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
PKP4-208ENST00000462335 MVDP53602 400 aa8.62□□□□□ -1.03
PKP4-208ENST00000462335 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
PKP4-208ENST00000462335 OR2B6P58173 313 aa8.62□□□□□ -1.03
PKP4-208ENST00000462335 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
PKP4-208ENST00000462335 ELOA3BQ3SY89 546 aa8.62□□□□□ -1.03
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PKP4-208ENST00000462335 RTL6Q6ICC9 239 aa8.62□□□□□ -1.03
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PKP4-208ENST00000462335 STK32CQ86UX6 486 aa8.62□□□□□ -1.03
PKP4-208ENST00000462335 KIF18BQ86Y91 864 aa8.62□□□□□ -1.03
PKP4-208ENST00000462335 MSRB3Q8IXL7 192 aa8.62□□□□□ -1.03
PKP4-208ENST00000462335 RPRMLQ8N4K4 120 aa8.62□□□□□ -1.03
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PKP4-208ENST00000462335 OR2T12Q8NG77 320 aa8.62□□□□□ -1.03
PKP4-208ENST00000462335 OR52E4Q8NGH9 312 aa8.62□□□□□ -1.03
PKP4-208ENST00000462335 OR10D3Q8NH80 312 aa8.62□□□□□ -1.03
PKP4-208ENST00000462335 LZICQ8WZA0 190 aa8.62□□□□□ -1.03
PKP4-208ENST00000462335 PROX1Q92786 737 aa8.62□□□□□ -1.03
PKP4-208ENST00000462335 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
PKP4-208ENST00000462335 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa8.62□□□□□ -1.03
PKP4-208ENST00000462335 SLC39A3Q9BRY0 314 aa8.62□□□□□ -1.03
PKP4-208ENST00000462335 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
PKP4-208ENST00000462335 TRIM8Q9BZR9 551 aa8.62□□□□□ -1.03
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