RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 NANOGP8Q6NSW7 305 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 POMZP3Q6PJE2 187 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 SERPINA11Q86U17 422 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 SNX32Q86XE0 403 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 VRK2Q86Y07 508 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 NAXEQ8NCW5 288 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 OR8J3Q8NGG0 315 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 NFKBIDQ8NI38 313 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF563Q8TA94 476 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC35B4Q969S0 331 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 KLHL15Q96M94 604 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 CCDC106Q9BWC9 280 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 NANOGQ9H9S0 305 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 SERINC1Q9NRX5 453 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 GID8Q9NWU2 228 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 ARMCX1Q9P291 453 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 COL12A1Q99715 3063 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 A0A0J9YW62 118 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 CFAP73A6NFT4 308 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC22A20A6NK97 555 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 DVL2O14641 736 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 ADAM11O75078 769 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 TGM6O95932 706 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 UQCRBP14927 111 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 IL11P20809 199 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 RYKP34925 604 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 HTR3AP46098 478 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 MTPNP58546 118 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 SCARB2Q14108 478 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 SGCBQ16585 318 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF311Q5JNZ3 666 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 OR2A2Q6IF42 318 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF836Q6ZNA1 936 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF550Q7Z398 422 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 GRINAQ7Z429 371 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 P4HA3Q7Z4N8 544 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 KRT73Q86Y46 540 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC30A8Q8IWU4 369 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 C11orf65Q8NCR3 313 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 HIPK4Q8NE63 616 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 OR10D3Q8NH80 312 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 OR2V1Q8NHB1 315 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 PINK1Q9BXM7 581 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 UCK2Q9BZX2 261 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 MYLK2Q9H1R3 596 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 RLIMQ9NVW2 624 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM53CQ9NYF3 392 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 CHST2Q9Y4C5 530 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-204ENST00000442563 FXYD1O00168 92 aa15.14■□□□□ 0.01
RABGEF1-204ENST00000442563 SERPINB7O75635 380 aa15.14■□□□□ 0.01
RABGEF1-204ENST00000442563 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
RABGEF1-204ENST00000442563 PRKAR1BP31321 381 aa15.14■□□□□ 0.01
RABGEF1-204ENST00000442563 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
RABGEF1-204ENST00000442563 IDH2P48735 452 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
RABGEF1-204ENST00000442563 GZMMP51124 257 aa15.14■□□□□ 0.01
RABGEF1-204ENST00000442563 MAP2K6P52564 334 aa15.14■□□□□ 0.01
RABGEF1-204ENST00000442563 CARD18P57730 90 aa15.14■□□□□ 0.01
RABGEF1-204ENST00000442563 TFF3Q07654 80 aa15.14■□□□□ 0.01
RABGEF1-204ENST00000442563 MERTKQ12866 999 aa15.14■□□□□ 0.01
RABGEF1-204ENST00000442563 EPS8Q12929 822 aa15.14■□□□□ 0.01
RABGEF1-204ENST00000442563 SELPLGQ14242 412 aa15.14■□□□□ 0.01
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
RABGEF1-204ENST00000442563 PIGWQ7Z7B1 504 aa15.14■□□□□ 0.01
RABGEF1-204ENST00000442563 PTOV1Q86YD1 416 aa15.14■□□□□ 0.01
RABGEF1-204ENST00000442563 CLIP4Q8N3C7 705 aa15.14■□□□□ 0.01
RABGEF1-204ENST00000442563 ACBD4Q8NC06 268 aa15.14■□□□□ 0.01
RABGEF1-204ENST00000442563 FIG4Q92562 907 aa15.14■□□□□ 0.01
RABGEF1-204ENST00000442563 OSTF1Q92882 214 aa15.14■□□□□ 0.01
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF607Q96SK3 696 aa15.14■□□□□ 0.01
RABGEF1-204ENST00000442563 SFXN3Q9BWM7 321 aa15.14■□□□□ 0.01
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM107BQ9H098 131 aa15.14■□□□□ 0.01
RABGEF1-204ENST00000442563 RNF122Q9H9V4 155 aa15.14■□□□□ 0.01
RABGEF1-204ENST00000442563 TIGARQ9NQ88 270 aa15.14■□□□□ 0.01
RABGEF1-204ENST00000442563 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa15.14■□□□□ 0.01
RABGEF1-204ENST00000442563 HEATR5AQ86XA9 2040 aa15.14■□□□□ 0.01
RABGEF1-204ENST00000442563 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
RABGEF1-204ENST00000442563 PRORSD1PA6NEY8 169 aa15.13■□□□□ 0.01
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM90A27PA6NNH2 459 aa15.13■□□□□ 0.01
RABGEF1-204ENST00000442563 TNFSF11O14788 317 aa15.13■□□□□ 0.01
RABGEF1-204ENST00000442563 OPN1LWP04000 364 aa15.13■□□□□ 0.01
RABGEF1-204ENST00000442563 FCGR2AP12318 317 aa15.13■□□□□ 0.01
RABGEF1-204ENST00000442563 COX4I1P13073 169 aa15.13■□□□□ 0.01
RABGEF1-204ENST00000442563 COL8A1P27658 744 aa15.13■□□□□ 0.01
RABGEF1-204ENST00000442563 GRNP28799 593 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
RABGEF1-204ENST00000442563 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC1A3P43003 542 aa15.13■□□□□ 0.01
RABGEF1-204ENST00000442563 CLK1P49759 484 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
RABGEF1-204ENST00000442563 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
RABGEF1-204ENST00000442563 PON3Q15166 354 aa15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms