RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 IL32P24001 234 aa18.63■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 OR3A2P47893 321 aa18.63■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 CCR4P51679 360 aa18.63■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 ITGADQ13349 1161 aa18.63■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 GPR68Q15743 365 aa18.63■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 TIGD2Q4W5G0 525 aa18.63■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 NCMAPQ5T1S8 102 aa18.63■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 ANXA8L1Q5VT79 327 aa18.63■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 SSX8Q7RTT4 187 aa18.63■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 RFWD2Q8NHY2 731 aa18.63■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP18.63■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP18.63■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 DPY30Q9C005 99 aa18.63■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 PCDHGB4Q9UN71 923 aa18.63■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 RNF115Q9Y4L5 304 aa18.63■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa18.62■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa18.62■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 A0A1W2PNR3 127 aa18.62■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 TRIM64A6NGJ6 449 aa18.62■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 TRIM64BA6NI03 449 aa18.62■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF724A8MTY0 619 aa18.62■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF814B7Z6K7 855 aa18.62■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 ANKRD28O15084 1053 aa18.62■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 H6PDO95479 791 aa18.62■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 ADAP00813 363 aa18.62■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 CSTAP01040 98 aa18.62■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 DHRS4L1P0CG22 281 aa18.62■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 PGCP20142 388 aa18.62■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 UQCRC2P22695 453 aa18.62■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 TAB1Q15750 504 aa18.62■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 CHI3L2Q15782 390 aa18.62■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa18.62■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 C16orf62Q7Z3J2 963 aa18.62■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa18.62■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 VPS37AQ8NEZ2 397 aa18.62■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 OR4A15Q8NGL6 344 aa18.62■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP18.62■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 SAP130Q9H0E3 1048 aa18.62■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 OR51I1Q9H343 314 aa18.62■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 SERINC1Q9NRX5 453 aa18.62■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 ACER3Q9NUN7 267 aa18.62■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 MKLN1Q9UL63 735 aa18.62■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa18.62■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 DNHD1Q96M86 4753 aa18.61■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa18.61■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 PGM1P36871 562 aa18.61■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 RPL14P50914 215 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 SESN3P58005 492 aa18.61■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa18.61■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 KRT71Q3SY84 523 aa18.61■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 ATAD3BQ5T9A4 648 aa18.61■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 SAXO2Q658L1 398 aa18.61■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 CLEC4FQ8N1N0 589 aa18.61■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa18.61■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 OR5B2Q96R09 309 aa18.61■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 SORT1Q99523 831 aa18.61■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 C20orf27Q9GZN8 174 aa18.61■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 OVOL3O00110 214 aa18.6■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 CD3EP07766 207 aa18.6■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 COX5AP20674 150 aa18.6■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 DIO1P49895 249 aa18.6■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 PHC1P78364 1004 aa18.6■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 CASP8Q14790 479 aa18.6■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 PDK3Q15120 406 aa18.6■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 TSC22D1Q15714 1073 aa18.6■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 SYT14P1Q58G82 188 aa18.6■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa18.6■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 TMPPEQ6ZT21 453 aa18.6■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 FBXW5Q969U6 566 aa18.6■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 NEURL3Q96EH8 262 aa18.6■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 WDR45Q9Y484 360 aa18.6■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 FN1P02751 2386 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 ZANQ9Y493 2812 aa18.59■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa18.59■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 WDR91A4D1P6 747 aa18.59■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 DNPH1O43598 174 aa18.59■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 OR12D1P0DN82 309 aa18.59■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 SLC1A6P48664 564 aa18.59■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 FUT5Q11128 374 aa18.59■□□□□ 0.57
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