RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415172.1

VPS13A-AS1-201, VPS13A antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS13A-AS1, Length 519 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IL11P20809 199 aa15.63■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SESN3P58005 492 aa15.63■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PLAURQ03405 335 aa15.63■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GTF3C1Q12789 2109 aa15.63■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SCARB2Q14108 478 aa15.63■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF311Q5JNZ3 666 aa15.63■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PDSS1Q5T2R2 415 aa15.63■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RNF220Q5VTB9 566 aa15.63■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C11orf65Q8NCR3 313 aa15.63■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NAXEQ8NCW5 288 aa15.63■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LRRC58Q96CX6 371 aa15.63■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KLHL15Q96M94 604 aa15.63■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SH3GL1Q99961 368 aa15.63■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa15.63■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KCNJ16Q9NPI9 418 aa15.63■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SERINC1Q9NRX5 453 aa15.63■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ACER3Q9NUN7 267 aa15.63■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GID8Q9NWU2 228 aa15.63■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF175Q9Y473 711 aa15.63■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CFAP73A6NFT4 308 aa15.62■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FCGR2AP12318 317 aa15.62■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BMP5P22003 454 aa15.62■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SFTPDP35247 375 aa15.62■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RBBP4Q09028 425 aa15.62■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MERTKQ12866 999 aa15.62■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SELPLGQ14242 412 aa15.62■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PON3Q15166 354 aa15.62■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa15.62■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OR2A2Q6IF42 318 aa15.62■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C3orf33Q6P1S2 294 aa15.62■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PLXDC2Q6UX71 529 aa15.62■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SERPINA11Q86U17 422 aa15.62■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HIPK4Q8NE63 616 aa15.62■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OR8J3Q8NGG0 315 aa15.62■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OR10D3Q8NH80 312 aa15.62■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OR2V1Q8NHB1 315 aa15.62■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF524Q96C55 264 aa15.62■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC39A3Q9BRY0 314 aa15.62■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SPATA9Q9BWV2 254 aa15.62■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RLIMQ9NVW2 624 aa15.62■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CACNA1DQ01668 2161 aa15.62■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MYO7BQ6PIF6 2116 aa15.61■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FXYD1O00168 92 aa15.61■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TNFSF11O14788 317 aa15.61■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ADAMDEC1O15204 470 aa15.61■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RCBTB2O95199 551 aa15.61■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TGM6O95932 706 aa15.61■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OPN1LWP04000 364 aa15.61■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CTSSP25774 331 aa15.61■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC7A1P30825 629 aa15.61■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OPRM1P35372 400 aa15.61■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IDH2P48735 452 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF136P52737 540 aa15.61■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ADRM1Q16186 407 aa15.61■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HBMQ6B0K9 141 aa15.61■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NANOGP8Q6NSW7 305 aa15.61■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PPP4R4Q6NUP7 873 aa15.61■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 POMZP3Q6PJE2 187 aa15.61■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa15.61■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF550Q7Z398 422 aa15.61■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GRINAQ7Z429 371 aa15.61■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LIX1LQ8IVB5 337 aa15.61■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 POU5F2Q8N7G0 328 aa15.61■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa15.61■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OR10A6Q8NH74 314 aa15.61■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ADGRG7Q96K78 797 aa15.61■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF607Q96SK3 696 aa15.61■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CCDC106Q9BWC9 280 aa15.61■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 UCK2Q9BZX2 261 aa15.61■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NANOGQ9H9S0 305 aa15.61■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TIGARQ9NQ88 270 aa15.61■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 A0A0J9YW62 118 aa15.6■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NKX2-6A6NCS4 301 aa15.6■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FAAHO00519 579 aa15.6■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 AP3D1O14617 1153 aa15.6■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EFNA2O43921 213 aa15.6■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ADAM11O75078 769 aa15.6■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SERPINB7O75635 380 aa15.6■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SYNGR4O95473 234 aa15.6■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 COX4I1P13073 169 aa15.6■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 COL8A1P27658 744 aa15.6■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GRNP28799 593 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 AQP1P29972 269 aa15.6■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PRKAR1BP31321 381 aa15.6■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HTR3AP46098 478 aa15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.1 ms