RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412806.1

SH3BP5-204, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP5, Length 1,900 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-204ENST00000412806 TRAV27A0A087WT01 109 aa19.78■□□□□ 0.76
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SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
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SH3BP5-204ENST00000412806 HSMCR30P0CW71 290 aa19.74■□□□□ 0.75
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SH3BP5-204ENST00000412806 PAQR6Q6TCH4 344 aa19.74■□□□□ 0.75
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SH3BP5-204ENST00000412806 LNX2Q8N448 690 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP5-204ENST00000412806 BBS1Q8NFJ9 593 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP5-204ENST00000412806 C8orf44Q96CB5 159 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP5-204ENST00000412806 IFT27Q9BW83 186 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP5-204ENST00000412806 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
SH3BP5-204ENST00000412806 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
SH3BP5-204ENST00000412806 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
SH3BP5-204ENST00000412806 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
SH3BP5-204ENST00000412806 A0A1W2PQD3 144 aa19.74■□□□□ 0.75
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