RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380221.7

TRAPPC10-202, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC10, Length 1,763 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-202ENST00000380221 CPNE5Q9HCH3 593 aa25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC10-202ENST00000380221 SCOCQ9UIL1 159 aa25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC10-202ENST00000380221 HRH3Q9Y5N1 445 aa25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC10-202ENST00000380221 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC10-202ENST00000380221 A0A1W2PRQ8 180 aa25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC10-202ENST00000380221 ARRDC5A6NEK1 342 aa25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC10-202ENST00000380221 G3V3Y1 287 aa25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC10-202ENST00000380221 FMO6PO60774 539 aa25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC10-202ENST00000380221 THY1P04216 161 aa25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC10-202ENST00000380221 CASRP41180 1078 aa25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC10-202ENST00000380221 DGCR6Q14129 220 aa25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC10-202ENST00000380221 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC10-202ENST00000380221 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC10-202ENST00000380221 NR4A3Q92570 626 aa25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC10-202ENST00000380221 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC10-202ENST00000380221 ANGPTL4Q9BY76 406 aa25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC10-202ENST00000380221 CNIH4Q9P003 139 aa25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC10-202ENST00000380221 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC10-202ENST00000380221 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC10-202ENST00000380221 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLC16A6O15403 523 aa25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC10-202ENST00000380221 TNFAIP8O95379 198 aa25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC10-202ENST00000380221 ITPKBP27987 946 aa25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC10-202ENST00000380221 P2RX1P51575 399 aa25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC10-202ENST00000380221 SEC23BQ15437 767 aa25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC10-202ENST00000380221 COL28A1Q2UY09 1125 aa25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLC30A6Q6NXT4 461 aa25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC10-202ENST00000380221 PSD4Q8NDX1 1056 aa25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF524Q96C55 264 aa25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC10-202ENST00000380221 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC10-202ENST00000380221 SDHAF3Q9NRP4 125 aa25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC10-202ENST00000380221 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC10-202ENST00000380221 PCNX3Q9H6A9 2034 aa25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 FAAHO00519 579 aa25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 NEURL1O76050 574 aa25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 MFAP5Q13361 173 aa25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 BROXQ5VW32 411 aa25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 CADM2Q8N3J6 435 aa25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 AQP11Q8NBQ7 271 aa25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLC41A3Q96GZ6 507 aa25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 FUZQ9BT04 418 aa25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 TRIM2Q9C040 744 aa25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMEM27Q9HBJ8 222 aa25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 MED11Q9P086 117 aa25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 ACACAQ13085 2346 aa25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR5F1O95221 314 aa25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 NUDT14O95848 222 aa25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 P04436 131 aa25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 CBLP22681 906 aa25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 IDH2P48735 452 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR1C1Q15619 314 aa25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 GDF7Q7Z4P5 450 aa25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 LSMEM1Q8N8F7 131 aa25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR5W2Q8NH69 310 aa25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLC7A13Q8TCU3 470 aa25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 FRMD6Q96NE9 622 aa25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 GRIP2Q9C0E4 1043 aa25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF556Q9HAH1 456 aa25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLC7A7Q9UM01 511 aa25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 POFUT2Q9Y2G5 429 aa25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 URB1O60287 2271 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 IFNA8P32881 189 aa25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLC6A8P48029 635 aa25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 COPZ1P61923 177 aa25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 ST3GAL3Q11203 375 aa25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 NTNG2Q96CW9 530 aa25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 SACM1LQ9NTJ5 587 aa25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 A0A1B0GWA3 101 aa25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 TRAPPC13A5PLN9 417 aa25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 ANKRD33BA6NCL7 494 aa25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 BCKDKO14874 412 aa25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 CEACAM4O75871 244 aa25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 GASTP01350 101 aa25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 CBFBQ13951 182 aa25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 PODNL1Q6PEZ8 512 aa25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 WDSUB1Q8N9V3 476 aa25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF563Q8TA94 476 aa25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 GABARAPL3Q9BY60 117 aa25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF696Q9H7X3 374 aa25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 SH3PXD2BA1X283 911 aa25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR5H15A6NDH6 313 aa25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 K7ENP7 123 aa25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR10H3O60404 316 aa25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 NTN1O95631 604 aa25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 POU2F1P14859 743 aa25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 NPRL3Q12980 569 aa25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF613Q6PF04 617 aa25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 NKAIN4Q8IVV8 208 aa25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC10-202ENST00000380221 RNF217Q8TC41 542 aa25.23■■□□□ 1.63
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