RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371746.7

LHX3-201, Transcript of LIM homeobox 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LHX3, Length 2,403 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3-201ENST00000371746 EID2Q8N6I1 236 aa21.8■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 DTNBP1Q96EV8 351 aa21.8■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 OR6C1Q96RD1 312 aa21.8■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa21.8■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 MESP1Q9BRJ9 268 aa21.8■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa21.79■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 LRRN3E7EW58 273 aa21.79■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 UTS2O95399 124 aa21.79■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 IL33O95760 270 aa21.79■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 RBM34P42696 430 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 CCR4P51679 360 aa21.79■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 LINC00114Q6XXX2 140 aa21.79■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 LHFPL3Q86UP9 236 aa21.79■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 MCFD2Q8NI22 146 aa21.79■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 GATAD2BQ8WXI9 593 aa21.79■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 SLC35B4Q969S0 331 aa21.79■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 LRRN3Q9H3W5 708 aa21.79■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa21.79■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 LIMS3P0CW19 117 aa21.79■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 LIMS4P0CW20 117 aa21.79■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 EBPQ15125 230 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 COX15Q7KZN9 410 aa21.79■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa21.79■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 KBTBD8Q8NFY9 601 aa21.79■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa21.79■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa21.79■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 TM9SF4Q92544 642 aa21.79■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 AKIP1Q9NQ31 210 aa21.79■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 FRG2CA6NGY1 282 aa21.78■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 CLDN25C9JDP6 229 aa21.78■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 HCN1O60741 890 aa21.78■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 PTP4A3O75365 173 aa21.78■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 PNLIPP16233 465 aa21.78■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 CALRP27797 417 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 HTR1FP30939 366 aa21.78■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 COPZ1P61923 177 aa21.78■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 FOXK2Q01167 660 aa21.78■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 ZSWIM7Q19AV6 140 aa21.78■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa21.78■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 PHC2Q8IXK0 858 aa21.78■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa21.78■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 ADAMTS20P59510 1910 aa21.78■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 BDP1A6H8Y1 2624 aa21.78■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 TECTAO75443 2155 aa21.78■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa21.78■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 SLC9A3P48764 834 aa21.78■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 WNT4P56705 351 aa21.78■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 FHL1Q13642 323 aa21.78■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 FNDC7Q5VTL7 733 aa21.78■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 PRR23CQ6ZRP0 262 aa21.78■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 LRRC17Q8N6Y2 441 aa21.78■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 KLHDC3Q9BQ90 382 aa21.78■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 MCCC2Q9HCC0 563 aa21.78■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa21.77■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 IRGMA1A4Y4 181 aa21.77■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 SCDO00767 359 aa21.77■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 PPP1R3DO95685 299 aa21.77■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 RHBDD2Q6NTF9 364 aa21.77■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa21.77■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 IGFN1Q86VF2 1251 aa21.77■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 ZNF527Q8NB42 609 aa21.77■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 C3orf49Q96BT1 292 aa21.77■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 RTN4RQ9BZR6 473 aa21.77■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 NDUFB11Q9NX14 153 aa21.77■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 CFL2Q9Y281 166 aa21.77■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 LRRTM2O43300 516 aa21.77■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 ICOSLGO75144 302 aa21.77■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 REM1O75628 298 aa21.77■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 UBL4AP11441 157 aa21.77■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 BMP4P12644 408 aa21.77■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 ATP6V1E1P36543 226 aa21.77■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 ZNF404Q494X3 552 aa21.77■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 SIRT6Q8N6T7 355 aa21.77■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 FAM71CQ8NEG0 241 aa21.77■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 TMEM203Q969S6 136 aa21.77■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 ZNF524Q96C55 264 aa21.77■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 HMG20AQ9NP66 347 aa21.77■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 FBXO8Q9NRD0 319 aa21.77■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 SRPK3Q9UPE1 567 aa21.77■■□□□ 1.08
LHX3-201ENST00000371746 TMEM129A0AVI4 362 aa21.76■■□□□ 1.07
LHX3-201ENST00000371746 C17orf51A8MQB3 221 aa21.76■■□□□ 1.07
LHX3-201ENST00000371746 GMFGO60234 142 aa21.76■■□□□ 1.07
LHX3-201ENST00000371746 SLC1A3P43003 542 aa21.76■■□□□ 1.07
LHX3-201ENST00000371746 SKP2Q13309 424 aa21.76■■□□□ 1.07
LHX3-201ENST00000371746 TMEM44Q2T9K0 475 aa21.76■■□□□ 1.07
LHX3-201ENST00000371746 OR51G2Q8NGK0 314 aa21.76■■□□□ 1.07
LHX3-201ENST00000371746 OR14A16Q8NHC5 309 aa21.76■■□□□ 1.07
LHX3-201ENST00000371746 STT3BQ8TCJ2 826 aa21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms