RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367651.3

CITED2-201, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED2, Length 2,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2-201ENST00000367651 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 UCKL1Q9NWZ5 548 aa17.39■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 GLTPQ9NZD2 209 aa17.39■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 XIRP2A4UGR9 3374 aa17.38■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa17.38■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 CIB4A0PJX0 185 aa17.38■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 PRR19A6NJB7 356 aa17.38■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 GPR171O14626 319 aa17.38■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 SHOXO15266 292 aa17.38■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 MPC2O95563 127 aa17.38■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 SAGP10523 405 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 ZP1P60852 638 aa17.38■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 TNFRSF17Q02223 184 aa17.38■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 FAM78AQ5JUQ0 283 aa17.38■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa17.38■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa17.38■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 ZNF350Q9GZX5 532 aa17.38■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 ADAP2Q9NPF8 381 aa17.38■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 KCMF1Q9P0J7 381 aa17.38■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 FAM86C2PA6NEL3 165 aa17.38■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 P2RX6O15547 441 aa17.38■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 EML2O95834 649 aa17.38■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 CD53P19397 219 aa17.38■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 CTNNB1P35222 781 aa17.38■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 CAMK2DQ13557 499 aa17.38■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa17.38■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 TMEFF1Q8IYR6 380 aa17.38■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 SLC44A3Q8N4M1 653 aa17.38■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 INPP5EQ9NRR6 644 aa17.38■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 AUP1Q9Y679 476 aa17.38■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 A0A1W2PP55 124 aa17.37■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 G3V3Q6 166 aa17.37■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 UBL3O95164 117 aa17.37■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 TFP02787 698 aa17.37■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 HPXP02790 462 aa17.37■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 DRD5P21918 477 aa17.37■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 TSFMP43897 325 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 RGS1Q08116 209 aa17.37■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 RUNX2Q13950 521 aa17.37■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 C2orf27AQ580R0 203 aa17.37■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 WDR45BQ5MNZ6 344 aa17.37■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 FIGNL1Q6PIW4 674 aa17.37■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 ZAR1Q86SH2 424 aa17.37■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 OR4E2Q8NGC2 313 aa17.37■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 SPPL3Q8TCT6 385 aa17.37■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 GRHL3Q8TE85 626 aa17.37■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 ORAI1Q96D31 301 aa17.37■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 SORCS2Q96PQ0 1159 aa17.37■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 TIMM29Q9BSF4 260 aa17.37■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 DIABLOQ9NR28 239 aa17.37■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa17.37■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 ZNF860A6NHJ4 632 aa17.37■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 THBS1P07996 1170 aa17.37■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 SULT1A3P0DMM9 295 aa17.37■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 SULT1A4P0DMN0 295 aa17.37■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 EPXP11678 715 aa17.37■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 ZNF250P15622 560 aa17.37■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 CMPK1P30085 196 aa17.37■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 MMP15P51511 669 aa17.37■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 NRG3P56975 720 aa17.37■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 FGFBP1Q14512 234 aa17.37■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 DEFB134Q4QY38 66 aa17.37■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 EIPR1Q53HC9 387 aa17.37■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 DCST2Q5T1A1 773 aa17.37■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 PAQR7Q86WK9 346 aa17.37■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 ZNF619Q8N2I2 560 aa17.37■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 HDDC3Q8N4P3 179 aa17.37■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 GAL3ST3Q96A11 431 aa17.37■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 BRD7Q9NPI1 651 aa17.37■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 DLL4Q9NR61 685 aa17.37■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa17.37■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 MEIKINA0A087WXM9 373 aa17.36■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 H2AFB2P0C5Z0 115 aa17.36■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 NID1P14543 1247 aa17.36■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 TMEM255AQ5JRV8 349 aa17.36■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa17.36■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 OR51L1Q8NGJ5 315 aa17.36■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa17.36■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 HGDQ93099 445 aa17.36■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 CCDC120Q96HB5 630 aa17.36■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 FLVCR2Q9UPI3 526 aa17.36■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
CITED2-201ENST00000367651 REV3LO60673 3130 aa17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms