RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356331.9

SH3BP2-201, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-201ENST00000356331 OR6F1Q8NGZ6 308 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 TANKQ92844 425 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 PGAM5Q96HS1 289 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 A0A087WZY1 265 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 LOC730098B7Z3J9 87 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 NDUFB2O95178 105 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 MMP3P08254 477 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 GABRR2P28476 465 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 MAP4K2Q12851 820 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 LTB4RQ15722 352 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 FAM111BQ6SJ93 734 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 NXPE4Q6UWF7 544 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 OR13C4Q8NGS5 318 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 OR9A2Q8NGT5 310 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 CLEC4CQ8WTT0 213 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 GSX2Q9BZM3 304 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 FAM186AA6NE01 2351 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 PTHP01270 115 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 SULT1A2P50226 295 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 TMPPEQ6ZT21 453 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 CLRN3Q8NCR9 226 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 ZBTB8AQ96BR9 441 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 SERTAD3Q9UJW9 196 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 ITGB4P16144 1822 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 CYTIPO60759 359 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 MTNR1BP49286 362 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 DCAF4L2Q8NA75 395 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 MIB2Q96AX9 1013 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 HRH4Q9H3N8 390 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 RRAGCQ9HB90 399 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 V9GYS6 101 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 CD300LBA8K4G0 201 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 CCL16O15467 120 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 OR2T1O43869 369 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 RAF1P04049 648 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 KCNJ5P48544 419 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 SH3BP2P78314 561 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 NOGQ13253 232 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 TIGD5Q53EQ6 642 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 IGSF11Q5DX21 431 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 RREB1Q92766 1687 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 CLEC3AO75596 197 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 ALPIP09923 528 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 PLGLB1Q02325 96 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 PAGE3Q5JUK9 113 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 RCBTB1Q8NDN9 531 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 SGK3Q96BR1 496 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 NARFLQ9H6Q4 476 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 CAMK2AQ9UQM7 478 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 BCL9O00512 1426 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 SERPINA7P05543 415 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 OR4Q2P0C623 313 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 TNK1Q13470 666 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 TCTE1Q5JU00 501 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 CPZQ66K79 652 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 GPR150Q8NGU9 434 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 NETO1Q8TDF5 533 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 OR10A5Q9H207 317 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 OR10A2Q9H208 303 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 METTL7AQ9H8H3 244 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 FOCADQ5VW36 1801 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 E5RGE8 158 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 SOX18P35713 384 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 C17orf107Q6ZR85 190 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 WDR5BQ86VZ2 330 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 ANKK1Q8NFD2 765 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 TEPSINQ96N21 525 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 NEURL2Q9BR09 285 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF251Q9BRH9 671 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 GMEB2Q9UKD1 530 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 A0A087WUU8 490 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 ARNTLO00327 626 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 PEX10O60683 326 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 GBAP04062 536 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 IL1RNP18510 177 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 GJA5P36382 358 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 SELENOWP63302 87 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 LRRC32Q14392 662 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-201ENST00000356331 IL34Q6ZMJ4 242 aa10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms