RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM178AQ8NBL3 297 aa24.96■■□□□ 1.59
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CTDNEP1-201ENST00000318988 MPP4Q96JB8 637 aa24.96■■□□□ 1.59
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CTDNEP1-201ENST00000318988 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa24.96■■□□□ 1.59
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CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A1W2PRS3 328 aa24.94■■□□□ 1.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 KIR3DP1A8MWS1 328 aa24.94■■□□□ 1.58
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF766Q5HY98 468 aa24.94■■□□□ 1.58
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CTDNEP1-201ENST00000318988 NKAIN4Q8IVV8 208 aa24.94■■□□□ 1.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 HS3ST5Q8IZT8 346 aa24.94■■□□□ 1.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 CBR4Q8N4T8 237 aa24.94■■□□□ 1.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 ELOA3Q8NG57 546 aa24.94■■□□□ 1.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR2M7Q8NG81 312 aa24.94■■□□□ 1.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR10G2Q8NGC3 310 aa24.94■■□□□ 1.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 C3orf49Q96BT1 292 aa24.94■■□□□ 1.58
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CTDNEP1-201ENST00000318988 GNRHR2Q96P88 292 aa24.94■■□□□ 1.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 KLHDC3Q9BQ90 382 aa24.94■■□□□ 1.58
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CTDNEP1-201ENST00000318988 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa24.93■■□□□ 1.58
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa24.91■■□□□ 1.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRAV17A0A0B4J275 112 aa24.91■■□□□ 1.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 RASAL1O95294 804 aa24.91■■□□□ 1.58
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CTDNEP1-201ENST00000318988 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 MERTKQ12866 999 aa24.91■■□□□ 1.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM255BQ8WV15 326 aa24.91■■□□□ 1.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM239Q8WW34 195 aa24.91■■□□□ 1.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRSS27Q9BQR3 290 aa24.91■■□□□ 1.58
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