RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309641.10

PDE4D-201, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,025 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-201ENST00000309641 CTPS2Q9NRF8 586 aa8.2□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 CAMK2AQ9UQM7 478 aa8.2□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 A0A087WZY1 265 aa8.2□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa8.2□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 OR14I1A6ND48 311 aa8.2□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 LRRTM2O43300 516 aa8.2□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 SEC14L5O43304 696 aa8.2□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 SERPINB7O75635 380 aa8.2□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 PDE5AO76074 875 aa8.2□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 LGI1O95970 557 aa8.2□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 FESP07332 822 aa8.2□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF708P17019 499 aa8.2□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 PGCP20142 388 aa8.2□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 CHMP24386 653 aa8.2□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 SFTPDP35247 375 aa8.2□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 OR1E2P47887 323 aa8.2□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 MNAT1P51948 309 aa8.2□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 BNIP1Q12981 228 aa8.2□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 NPTX1Q15818 432 aa8.2□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 SLC25A53Q5H9E4 307 aa8.2□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 C16orf89Q6UX73 402 aa8.2□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 GGNQ86UU5 652 aa8.2□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 MARVELD2Q8N4S9 558 aa8.2□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 OR6T1Q8NGN1 323 aa8.2□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF563Q8TA94 476 aa8.2□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 ZBTB8AQ96BR9 441 aa8.2□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 SARAFQ96BY9 339 aa8.2□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 PIGQQ9BRB3 760 aa8.2□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa8.2□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 PINK1Q9BXM7 581 aa8.2□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 FAM215AQ9Y5M1 114 aa8.2□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 A0A0J9YW62 118 aa8.19□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 C7orf72A4D263 438 aa8.19□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 PRRG2O14669 202 aa8.19□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 ACTL6AO96019 429 aa8.19□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 HSD17B1P14061 328 aa8.19□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 GGT1P19440 569 aa8.19□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 CCNA2P20248 432 aa8.19□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 FUT4P22083 530 aa8.19□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 CA7P43166 264 aa8.19□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 RBPJQ06330 500 aa8.19□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 MERTKQ12866 999 aa8.19□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 CYBRD1Q53TN4 286 aa8.19□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 WLSQ5T9L3 541 aa8.19□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 AAGABQ6PD74 315 aa8.19□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 RPTNQ6XPR3 784 aa8.19□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 SEM1Q6ZVN7 128 aa8.19□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa8.19□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 VTCN1Q7Z7D3 282 aa8.19□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 SLC30A8Q8IWU4 369 aa8.19□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 ULK2Q8IYT8 1036 aa8.19□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 LILRA2Q8N149 483 aa8.19□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 CADM2Q8N3J6 435 aa8.19□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 FAM86B1Q8N7N1 296 aa8.19□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 SLC26A7Q8TE54 656 aa8.19□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 MRGPRX4Q96LA9 322 aa8.19□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 TUBA1CQ9BQE3 449 aa8.19□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 PRDM14Q9GZV8 571 aa8.19□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 SH3GLB1Q9Y371 365 aa8.19□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 SNX13Q9Y5W8 968 aa8.19□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 BCKDKO14874 412 aa8.19□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 GSTA4O15217 222 aa8.19□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 SERPINA1P01009 418 aa8.19□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 GP1BBP13224 206 aa8.19□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 CPN1P15169 458 aa8.19□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF17P17021 662 aa8.19□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 PTNP21246 168 aa8.19□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 HTR1EP28566 365 aa8.19□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 TACR3P29371 465 aa8.19□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 MS4A2Q01362 244 aa8.19□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 BNIP2Q12982 314 aa8.19□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 FXNQ16595 210 aa8.19□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 NRF1Q16656 503 aa8.19□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 GLYATQ6IB77 296 aa8.19□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 ENPP6Q6UWR7 440 aa8.19□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF550Q7Z398 422 aa8.19□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 ADGRG3Q86Y34 549 aa8.19□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 ST8SIA1Q92185 356 aa8.19□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 TPD52L3Q96J77 140 aa8.19□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 ARHGDIGQ99819 225 aa8.19□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 THTPAQ9BU02 230 aa8.19□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 OR11A1Q9GZK7 315 aa8.19□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 ACER3Q9NUN7 267 aa8.19□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 OSGIN1Q9UJX0 560 aa8.19□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 AP3M1Q9Y2T2 418 aa8.19□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 A0A1W2PNR3 127 aa8.18□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
PDE4D-201ENST00000309641 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa8.18□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56 ms