RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 AADACL4Q5VUY2 407 aa20.86■□□□□ 0.93
VSTM4-201ENST00000298454 SMARCD3Q6STE5 483 aa20.86■□□□□ 0.93
VSTM4-201ENST00000298454 PAQR6Q6TCH4 344 aa20.86■□□□□ 0.93
VSTM4-201ENST00000298454 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa20.86■□□□□ 0.93
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF440Q8IYI8 595 aa20.86■□□□□ 0.93
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF441Q8N8Z8 693 aa20.86■□□□□ 0.93
VSTM4-201ENST00000298454 C3orf49Q96BT1 292 aa20.86■□□□□ 0.93
VSTM4-201ENST00000298454 LGALS12Q96DT0 336 aa20.86■□□□□ 0.93
VSTM4-201ENST00000298454 OMA1Q96E52 524 aa20.86■□□□□ 0.93
VSTM4-201ENST00000298454 RNFT2Q96EX2 444 aa20.86■□□□□ 0.93
VSTM4-201ENST00000298454 KLHDC3Q9BQ90 382 aa20.86■□□□□ 0.93
VSTM4-201ENST00000298454 A0A087WUJ7 227 aa20.86■□□□□ 0.93
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF264O43296 627 aa20.86■□□□□ 0.93
VSTM4-201ENST00000298454 ALOX12BO75342 701 aa20.86■□□□□ 0.93
VSTM4-201ENST00000298454 PTP4A3O75365 173 aa20.86■□□□□ 0.93
VSTM4-201ENST00000298454 ABCD3P28288 659 aa20.86■□□□□ 0.93
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF528Q3MIS6 628 aa20.86■□□□□ 0.93
VSTM4-201ENST00000298454 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa20.86■□□□□ 0.93
VSTM4-201ENST00000298454 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa20.86■□□□□ 0.93
VSTM4-201ENST00000298454 BBS1Q8NFJ9 593 aa20.86■□□□□ 0.93
VSTM4-201ENST00000298454 MGLLQ99685 303 aa20.86■□□□□ 0.93
VSTM4-201ENST00000298454 MED17Q9NVC6 651 aa20.86■□□□□ 0.93
VSTM4-201ENST00000298454 ERGIC3Q9Y282 383 aa20.86■□□□□ 0.93
VSTM4-201ENST00000298454 FAM183AA6NL82 134 aa20.85■□□□□ 0.93
VSTM4-201ENST00000298454 VSTM2BA6NLU5 285 aa20.85■□□□□ 0.93
VSTM4-201ENST00000298454 C17orf51A8MQB3 221 aa20.85■□□□□ 0.93
VSTM4-201ENST00000298454 SLC22A1O15245 554 aa20.85■□□□□ 0.93
VSTM4-201ENST00000298454 RCBTB2O95199 551 aa20.85■□□□□ 0.93
VSTM4-201ENST00000298454 HMGN1P05114 100 aa20.85■□□□□ 0.93
VSTM4-201ENST00000298454 HBQ1P09105 142 aa20.85■□□□□ 0.93
VSTM4-201ENST00000298454 FGF5P12034 268 aa20.85■□□□□ 0.93
VSTM4-201ENST00000298454 GADD45AP24522 165 aa20.85■□□□□ 0.93
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VSTM4-201ENST00000298454 OAFQ86UD1 273 aa20.85■□□□□ 0.93
VSTM4-201ENST00000298454 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
VSTM4-201ENST00000298454 OIT3Q8WWZ8 545 aa20.85■□□□□ 0.93
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF524Q96C55 264 aa20.85■□□□□ 0.93
VSTM4-201ENST00000298454 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa20.85■□□□□ 0.93
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VSTM4-201ENST00000298454 MTNR1AP48039 350 aa20.85■□□□□ 0.93
VSTM4-201ENST00000298454 EMP2P54851 167 aa20.85■□□□□ 0.93
VSTM4-201ENST00000298454 CDH11P55287 796 aa20.85■□□□□ 0.93
VSTM4-201ENST00000298454 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
VSTM4-201ENST00000298454 SHFQ7M4L6 423 aa20.85■□□□□ 0.93
VSTM4-201ENST00000298454 APCDD1LQ8NCL9 501 aa20.85■□□□□ 0.93
VSTM4-201ENST00000298454 TBC1D15Q8TC07 691 aa20.85■□□□□ 0.93
VSTM4-201ENST00000298454 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
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VSTM4-201ENST00000298454 ZNF28P17035 718 aa20.84■□□□□ 0.93
VSTM4-201ENST00000298454 RNF4P78317 190 aa20.84■□□□□ 0.93
VSTM4-201ENST00000298454 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
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VSTM4-201ENST00000298454 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa20.84■□□□□ 0.93
VSTM4-201ENST00000298454 MARCH3Q86UD3 253 aa20.84■□□□□ 0.93
VSTM4-201ENST00000298454 SLCO6A1Q86UG4 719 aa20.84■□□□□ 0.93
VSTM4-201ENST00000298454 BMPERQ8N8U9 685 aa20.84■□□□□ 0.93
VSTM4-201ENST00000298454 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
VSTM4-201ENST00000298454 METTL21AQ8WXB1 218 aa20.84■□□□□ 0.93
VSTM4-201ENST00000298454 HSPBAP1Q96EW2 488 aa20.84■□□□□ 0.93
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VSTM4-201ENST00000298454 SAGE2PA6NJ88 616 aa20.83■□□□□ 0.93
VSTM4-201ENST00000298454 AIREO43918 545 aa20.83■□□□□ 0.93
VSTM4-201ENST00000298454 CCL4P13236 92 aa20.83■□□□□ 0.93
VSTM4-201ENST00000298454 IL11RAQ14626 422 aa20.83■□□□□ 0.93
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VSTM4-201ENST00000298454 KLHL22Q53GT1 634 aa20.83■□□□□ 0.93
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VSTM4-201ENST00000298454 LNX2Q8N448 690 aa20.83■□□□□ 0.93
VSTM4-201ENST00000298454 NANOGP1Q8N7R0 232 aa20.83■□□□□ 0.93
VSTM4-201ENST00000298454 OTULINQ96BN8 352 aa20.83■□□□□ 0.93
VSTM4-201ENST00000298454 MST1P26927 711 aa20.83■□□□□ 0.92
VSTM4-201ENST00000298454 ETV5P41161 510 aa20.83■□□□□ 0.92
VSTM4-201ENST00000298454 ETV1P50549 477 aa20.83■□□□□ 0.92
VSTM4-201ENST00000298454 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.92
VSTM4-201ENST00000298454 RAB40BQ12829 278 aa20.83■□□□□ 0.92
VSTM4-201ENST00000298454 RNLSQ5VYX0 342 aa20.83■□□□□ 0.92
VSTM4-201ENST00000298454 WBP2NLQ6ICG8 309 aa20.83■□□□□ 0.92
VSTM4-201ENST00000298454 LRRC17Q8N6Y2 441 aa20.83■□□□□ 0.92
VSTM4-201ENST00000298454 AGBL5Q8NDL9 886 aa20.83■□□□□ 0.92
VSTM4-201ENST00000298454 MND1Q9BWT6 205 aa20.83■□□□□ 0.92
VSTM4-201ENST00000298454 SEMA4CQ9C0C4 833 aa20.83■□□□□ 0.92
VSTM4-201ENST00000298454 MCCC2Q9HCC0 563 aa20.83■□□□□ 0.92
VSTM4-201ENST00000298454 ICAM5Q9UMF0 924 aa20.83■□□□□ 0.92
VSTM4-201ENST00000298454 SOCS6O14544 535 aa20.82■□□□□ 0.92
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