RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 FAM26EQ8N5C1 309 aa20.37■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 CLEC1BQ9P126 229 aa20.37■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 COL6A3P12111 3177 aa20.37■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 LRIT2A6NDA9 550 aa20.36■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 TAPBPO15533 448 aa20.36■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 ADAP00813 363 aa20.36■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 AQP1P29972 269 aa20.36■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 KIR3DL1P43629 444 aa20.36■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 XCR1P46094 333 aa20.36■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 MTNR1BP49286 362 aa20.36■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 MTAPQ13126 283 aa20.36■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 POM121L1PQ3SYA9 428 aa20.36■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 SLC25A30Q5SVS4 291 aa20.36■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 FAM69AQ5T7M9 428 aa20.36■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa20.36■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 ZNF613Q6PF04 617 aa20.36■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 B3GLCTQ6Y288 498 aa20.36■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 ZNF621Q6ZSS3 439 aa20.36■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 REC114Q7Z4M0 266 aa20.36■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 TPRA1Q86W33 373 aa20.36■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 ARRDC1Q8N5I2 433 aa20.36■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 MEIOBQ8N635 442 aa20.36■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 POMGNT2Q8NAT1 580 aa20.36■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 HUS1BQ8NHY5 278 aa20.36■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa20.36■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 IRGMA1A4Y4 181 aa20.36■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 OR2W5A6NFC9 320 aa20.36■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 SLC34A2O95436 690 aa20.36■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 ZNF44P15621 663 aa20.36■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 SDHBP21912 280 aa20.36■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 GALP22466 123 aa20.36■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 OR1E2P47887 323 aa20.36■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 GAS1P54826 345 aa20.36■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 CASP6P55212 293 aa20.36■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 SF1Q15637 639 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 XKR6Q5GH73 641 aa20.36■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa20.36■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 SCAMP4Q969E2 229 aa20.36■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 GGACTQ9BVM4 153 aa20.36■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 FAIM2Q9BWQ8 316 aa20.36■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 DZANK1Q9NVP4 752 aa20.36■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 ASB6Q9NWX5 421 aa20.36■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 FLVCR2Q9UPI3 526 aa20.36■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa20.35■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 PRAMEF25A6NGN4 478 aa20.35■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 GFYI3L273 518 aa20.35■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 DGKAP23743 735 aa20.35■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 NSG1P42857 185 aa20.35■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 HTR5AP47898 357 aa20.35■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 MVDP53602 400 aa20.35■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 RAB2AP61019 212 aa20.35■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 SHC2P98077 582 aa20.35■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 PITPNAQ00169 270 aa20.35■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 H3F3CQ6NXT2 135 aa20.35■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa20.35■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 COPS8Q99627 209 aa20.35■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 TMED9Q9BVK6 235 aa20.35■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 FXYD6Q9H0Q3 95 aa20.35■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 REEP4Q9H6H4 257 aa20.35■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 A0A1B0GVC2 190 aa20.35■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 A6NIN4 97 aa20.35■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 IMPA2O14732 288 aa20.35■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 MTX2O75431 263 aa20.35■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 UBL3O95164 117 aa20.35■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 CISD3P0C7P0 127 aa20.35■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 HSD3B1P14060 373 aa20.35■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 RPA2P15927 270 aa20.35■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 CSF2RBP32927 897 aa20.35■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 THBS2P35442 1172 aa20.35■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 GDF5P43026 501 aa20.35■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 NPBWR1P48145 328 aa20.35■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 DGCR2P98153 550 aa20.35■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa20.35■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 NR2C2APQ86WQ0 139 aa20.35■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 ZFP41Q8N8Y5 198 aa20.35■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 OTUB2Q96DC9 234 aa20.35■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 TSSK3Q96PN8 268 aa20.35■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 OPN4Q9UHM6 478 aa20.35■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 TRAPPC13A5PLN9 417 aa20.34■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 J3KTA2 159 aa20.34■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 MANBAO00462 879 aa20.34■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 ZNF197O14709 1029 aa20.34■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 IGHV2-5P01817 119 aa20.34■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 MGMTP16455 207 aa20.34■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 ABCD3P28288 659 aa20.34■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 CCR7P32248 378 aa20.34■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 RBP2P50120 134 aa20.34■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 DGKEP52429 567 aa20.34■□□□□ 0.85
PITX1-201ENST00000265340 IL20RBQ6UXL0 311 aa20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.4 ms