RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259607.6

CCL21-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 21, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL21, Length 852 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL21-201ENST00000259607 DLX5P56178 289 aa9.27□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 CTBP2P56545 445 aa9.27□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 SESN3P58005 492 aa9.27□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 CDK6Q00534 326 aa9.27□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 FUT5Q11128 374 aa9.27□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 MERTKQ12866 999 aa9.27□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 FOXF1Q12946 379 aa9.27□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 KLF10Q13118 480 aa9.27□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 PON3Q15166 354 aa9.27□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 MAPK14Q16539 360 aa9.27□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa9.27□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 RUNDC3AQ59EK9 446 aa9.27□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 ZNF311Q5JNZ3 666 aa9.27□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 PAGE3Q5JUK9 113 aa9.27□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 SERPINA11Q86U17 422 aa9.27□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 STK32CQ86UX6 486 aa9.27□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 TNIP2Q8NFZ5 429 aa9.27□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 OR8J3Q8NGG0 315 aa9.27□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 OR5M1Q8NGP8 315 aa9.27□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 DDIT4LQ96D03 193 aa9.27□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 CMTM5Q96DZ9 223 aa9.27□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 SLC39A3Q9BRY0 314 aa9.27□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa9.27□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa9.27□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 SLC52A3Q9NQ40 469 aa9.27□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 SLC6A13Q9NSD5 602 aa9.27□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 SELENONQ9NZV5 590 aa9.27□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 PACSIN3Q9UKS6 424 aa9.27□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 NCKAP5O14513 1909 aa9.27□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa9.26□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa9.26□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 SYT5O00445 386 aa9.26□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 MSTNO14793 375 aa9.26□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 TOXO94900 526 aa9.26□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 NTN1O95631 604 aa9.26□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 SSTR2P30874 369 aa9.26□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 LSP1P33241 339 aa9.26□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 CPA2P48052 419 aa9.26□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 CLDN20P56880 219 aa9.26□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 RAC3P60763 192 aa9.26□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 NCALDP61601 193 aa9.26□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 SORDQ00796 357 aa9.26□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 SCARB2Q14108 478 aa9.26□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 GTDC1Q4AE62 458 aa9.26□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 WBP2NLQ6ICG8 309 aa9.26□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 PPP4R4Q6NUP7 873 aa9.26□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 ERICH5Q6P6B1 374 aa9.26□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 DLEU7Q6UYE1 221 aa9.26□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa9.26□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 GDF7Q7Z4P5 450 aa9.26□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 GGNQ86UU5 652 aa9.26□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 RPRMLQ8N4K4 120 aa9.26□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 C9orf106Q8NAJ2 232 aa9.26□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 OR10D3Q8NH80 312 aa9.26□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 OSTF1Q92882 214 aa9.26□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 ECSITQ9BQ95 431 aa9.26□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 RNF122Q9H9V4 155 aa9.26□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa9.26□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa9.26□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 KCNN3Q9UGI6 736 aa9.26□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 CHRNA9Q9UGM1 479 aa9.26□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 KCNE5Q9UJ90 142 aa9.26□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa9.26□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 ICE1Q9Y2F5 2266 aa9.25□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa9.25□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 C17orf51A8MQB3 221 aa9.25□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 B4DXG7 233 aa9.25□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 TNFSF11O14788 317 aa9.25□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 MRASO14807 208 aa9.25□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 ZNF208O43345 1280 aa9.25□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 GOSR1O95249 250 aa9.25□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 TFPIP10646 304 aa9.25□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 CXCR1P25024 350 aa9.25□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 RYKP34925 604 aa9.25□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 SFTPDP35247 375 aa9.25□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 IDH2P48735 452 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 ZNF136P52737 540 aa9.25□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 EPS8Q12929 822 aa9.25□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 NDUFAF6Q330K2 333 aa9.25□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 SYT14P1Q58G82 188 aa9.25□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 TMEM201Q5SNT2 666 aa9.25□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 C5orf46Q6UWT4 87 aa9.25□□□□□ -0.93
CCL21-201ENST00000259607 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.8 ms