RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000132397.1

Gm20517-202, Transcript of Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gm20517, Length 4,807 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Fbxo42Q6PDJ6 717 aa15.88■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Slc35d3Q8BGF8 422 aa15.88■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ebf4Q8K4J2 599 aa15.88■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr1316Q8VG12 314 aa15.88■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cox4i2Q91W29 172 aa15.88■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tcf19Q99KJ5 263 aa15.88■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gdpd3Q99LY2 330 aa15.88■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Efcab11Q9D0E5 162 aa15.88■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Arv1Q9D0U9 266 aa15.88■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr955Q9EQ97 314 aa15.88■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Popdc3Q9ES81 291 aa15.88■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Trem1Q9JKE2 230 aa15.88■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Nfkb2Q9WTK5 899 aa15.88■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm17728E9Q5K2 132 aa15.88■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Bhlhe40O35185 411 aa15.88■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Edil3O35474 480 aa15.88■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 FiglaO55208 194 aa15.88■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 HbaP01942 142 aa15.88■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ankrd9Q8BH83 326 aa15.88■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Mrps28Q9CY16 186 aa15.88■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 CrtapQ9CYD3 400 aa15.88■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Slc6a19Q9D687 634 aa15.88■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Spaca1Q9DA48 305 aa15.88■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Plscr2Q9DCW2 307 aa15.88■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tas2r103Q9JKA3 312 aa15.88■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Scamp4Q9JKV5 230 aa15.88■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Phc2Q9QWH1 850 aa15.88■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Trpm6Q8CIR4 2028 aa15.87■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm29106A0A087WSP8 697 aa15.87■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 PdxpP60487 292 aa15.87■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Nr4a2Q06219 598 aa15.87■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Trim23Q8BGX0 574 aa15.87■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Clec9aQ8BRU4 238 aa15.87■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Rab7bQ8VEA8 199 aa15.87■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr1493-ps1A0A140LHU2 316 aa15.87■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Dcaf4A0A1Y7VNZ0 532 aa15.87■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 4930426L09RikE9Q0N7 123 aa15.87■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Aldh3b2E9Q3E1 479 aa15.87■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Pmm1O35621 262 aa15.87■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Matn3O35701 481 aa15.87■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Hoxa4P06798 285 aa15.87■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 RoraP51448 523 aa15.87■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Snrpd2P62317 118 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 SctQ08535 133 aa15.87■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tmem38aQ3TMP8 298 aa15.87■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Q3V0E1 1183 aa15.87■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Dcaf12l2Q8BGW4 469 aa15.87■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 RbksQ8R1Q9 323 aa15.87■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr1423Q8VFV0 310 aa15.87■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Sult1c2Q9D939 296 aa15.87■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Prmt1Q9JIF0 371 aa15.87■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm13283A0A087WPG5 182 aa15.87■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm14744B1AVU4 173 aa15.87■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm17067E9Q6S4 354 aa15.87■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Nmur1O55040 428 aa15.87■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 ArafP04627 604 aa15.87■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ca3P16015 260 aa15.87■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 DbhQ64237 622 aa15.87■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Grm7Q68ED2 915 aa15.87■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr309Q7TS01 308 aa15.87■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tmbim1Q8BJZ3 309 aa15.87■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ppp1r3bQ8C767 284 aa15.87■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Asb9Q91ZT8 290 aa15.87■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 5430402E10RikQ9D3N5 173 aa15.87■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cmtm2aQ9DAR1 169 aa15.87■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cdc40Q9DC48 579 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Sorcs1Q9JLC4 1167 aa15.87■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 SvilQ8K4L3 2170 aa15.87■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Xpnpep2B1AVD1 674 aa15.87■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm5519D3Z175 170 aa15.87■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr420E9Q4G0 321 aa15.87■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ifi204P0DOV2 619 aa15.87■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gstm3P19639 218 aa15.87■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Clec10aP49300 304 aa15.87■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ybx1P62960 322 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 D2hgdhQ8CIM3 535 aa15.87■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 C1qtnf2Q9D8U4 294 aa15.87■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Trip11E9Q512 1976 aa15.87■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Sult3a2G5E904 293 aa15.86■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm8888J3QPX5 126 aa15.86■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr1221L7MU53 311 aa15.86■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Vmn2r13L7N1X2 831 aa15.86■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 EmdO08579 259 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 MlxO08609 298 aa15.86■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 P01670 111 aa15.86■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 P01671 111 aa15.86■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 P01672 111 aa15.86■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Apoc3P33622 99 aa15.86■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Nox3Q672J9 568 aa15.86■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Slc22a18Q78KK3 406 aa15.86■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr1015Q7TR94 312 aa15.86■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Hrasls5Q9CPX5 270 aa15.86■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Neurl2Q9D0S4 285 aa15.86■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Calm4Q9JM83 148 aa15.86■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 SisF8VQM5 1818 aa15.86■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 PtprhE9Q0N2 971 aa15.86■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Pou3f3P31361 497 aa15.86■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Slc11a1P41251 548 aa15.86■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 InavaQ7TN12 663 aa15.86■□□□□ 0.13
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ankmy1Q8C0W1 906 aa15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 52.1 ms