RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620391.4

ITGB6-211, Transcript of integrin subunit beta 6, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene ITGB6, Length 4,401 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6-211ENST00000620391 SEMA4GQ9NTN9 838 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 KIF25Q9UIL4 384 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 A0A0A6YYH2 397 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 A6NJ64 397 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 TARM1B6A8C7 271 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 MED6O75586 246 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 SIX6O95475 246 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 DIRAS3O95661 229 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 ARNTP27540 789 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 HTR1FP30939 366 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 EVX1P49640 407 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 PPT1P50897 306 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 BLKP51451 505 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 SP3Q02447 781 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 FAM180BQ6P0A1 224 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 LRRTM3Q86VH5 581 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 HORMAD2Q8N7B1 307 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 PLA2G15Q8NCC3 412 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 RELTQ969Z4 430 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 MSLNLQ96KJ4 702 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 RNF208Q9H0X6 261 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 EGLN3Q9H6Z9 239 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 EVA1AQ9H8M9 152 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 SLAMF7Q9NQ25 335 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 TDP1Q9NUW8 608 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 DZANK1Q9NVP4 752 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 ZNF850A8MQ14 1090 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 NUDT19A8MXV4 375 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 M0QZQ0 153 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 PIP5K1CO60331 668 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 TGFBR1P36897 503 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 PSMB10P40306 273 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 GPLD1P80108 840 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 TDGQ13569 410 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 MFSD13AQ14CX5 517 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 PDGFRLQ15198 375 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 AANATQ16613 207 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 COMTD1Q86VU5 262 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 SLC38A5Q8WUX1 472 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 SLC38A3Q99624 504 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 PRRG4Q9BZD6 226 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 FAM86C1Q9NVL1 165 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 PGAP2Q9UHJ9 254 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 NME7Q9Y5B8 376 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 FEZF1A0PJY2 475 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 SLC22A23A1A5C7 686 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 DCDC2BA2VCK2 349 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 KIAA0355O15063 1070 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 TPOP07202 933 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 GJA5P36382 358 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 RAB28P51157 221 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 SYPL1Q16563 259 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 GPR157Q5UAW9 335 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 LPCAT3Q6P1A2 487 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 LCTLQ6UWM7 567 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 B3GLCTQ6Y288 498 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 PRSS58Q8IYP2 241 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 LSMEM1Q8N8F7 131 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 OR1M1Q8NGA1 313 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 NPLOC4Q8TAT6 608 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 C12orf57Q99622 126 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 PAAF1Q9BRP4 392 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 INSL5Q9Y5Q6 135 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 HCRTR2O43614 444 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 SCO1O75880 301 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 KCNK2O95069 426 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 GABRB1P18505 474 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 PPA1Q15181 289 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 TMEM207Q6UWW9 146 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 C17orf107Q6ZR85 190 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 ZNF280BQ86YH2 543 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 ZNF679Q8IYX0 411 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 RAB7BQ96AH8 199 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 TEPSINQ96N21 525 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 SYT17Q9BSW7 474 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 LTB4R2Q9NPC1 389 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
ITGB6-211ENST00000620391 ZNF226Q9NYT6 803 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms