RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609525.1

CSNK2A1-208, Transcript of casein kinase 2 alpha 1, human

TSL 5

Gene CSNK2A1, Length 581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ACSM1	Q08AH1	577 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ACSM2A	Q08AH3	577 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ST3GAL4	Q11206	333 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TAF10	Q12962	218 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TNK1	Q13470	666 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DGCR6	Q14129	220 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	IHH	Q14623	411 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RGN	Q15493	299 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TRAM1	Q15629	374 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CARD16	Q5EG05	197 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PDZK1	Q5T2W1	519 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DDI2	Q5TDH0	399 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PRAMEF8	Q5VWM4	474 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PRAMEF7	Q5VXH5	474 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ACSM2B	Q68CK6	577 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TPGS2	Q68CL5	300 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	HIST2H2AA3	Q6FI13	130 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	OR4F3	Q6IEY1	312 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ACSM6	Q6P461	480 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZNF621	Q6ZSS3	439 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	AHSA2	Q719I0	299 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LDB1	Q86U70	411 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NOXA1	Q86UR1	476 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SERPINA9	Q86WD7	417 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RASGRP3	Q8IV61	690 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RDH10	Q8IZV5	341 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	HJURP	Q8NCD3	748 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LPCAT1	Q8NF37	534 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	OR10G2	Q8NGC3	310 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	OR4C15	Q8NGM1	316 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CNIH3	Q8TBE1	160 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SETD7	Q8WTS6	366 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PIH1D2	Q8WWB5	315 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	WDR34	Q96EX3	536 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SCRN2	Q96FV2	425 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TMEM80	Q96HE8	168 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	HYLS1	Q96M11	299 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FOPNL	Q96NB1	174 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	QRFPR	Q96P65	431 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FEV	Q99581	238 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	EFCAB11	Q9BUY7	163 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GTPBP2	Q9BX10	602 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ACPT	Q9BZG2	426 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	C6orf62	Q9GZU0	229 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ASB8	Q9H765	288 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MARCH7	Q9H992	704 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SLC25A19	Q9HC21	320 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZFP14	Q9HCL3	533 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ARL15	Q9NXU5	204 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TAS2R9	Q9NYW1	312 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TAS2R7	Q9NYW3	318 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	EMC3	Q9P0I2	261 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	COPZ2	Q9P299	210 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CRLS1	Q9UJA2	301 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	KCND3	Q9UK17	655 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GMEB2	Q9UKD1	530 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TMCC3	Q9ULS5	477 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ANGPT4	Q9Y264	503 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	N6AMT1	Q9Y5N5	214 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RNF215	Q9Y6U7	377 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ENPP4	Q9Y6X5	453 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TRIO	O75962	3097 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ANKRD11	Q6UB99	2663 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CACNA1H	O95180	2353 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525		A0A1W2PRB8	838 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	C1orf226	A1L170	272 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	HYKK	A2RU49	373 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MEIOC	A2RUB1	952 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MGAT4D	A6NG13	374 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ANKRD61	A6NGH8	418 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NCF1B	A6NI72	391 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NCF1C	A8MVU1	366 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SCAMP2	O15127	329 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ORC5	O43913	435 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NBN	O60934	754 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SLCO2B1	O94956	709 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SOX30	O94993	753 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	KCNK2	O95069	426 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FADS2	O95864	444 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	IGSF6	O95976	241 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PDYN	P01213	254 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	C1QB	P02746	253 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MT-ND1	P03886	318 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CAT	P04040	527 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LCAT	P04180	440 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CSNK2A1-208	ENST00000609525	IFNW1	P05000	195 aa		4.23	□□□□□ -1.73

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