RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 DENRO43583 198 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 RYKP34925 604 aa28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 CBFBQ13951 182 aa28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC30A6Q6NXT4 461 aa28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 IL20RBQ6UXL0 311 aa28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF730Q6ZMV8 503 aa28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 SIRT6Q8N6T7 355 aa28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 OR9Q2Q8NGE9 314 aa28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 TFAP2CQ92754 450 aa28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 FGF11Q92914 225 aa28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 PRSS27Q9BQR3 290 aa28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 SCNM1Q9BWG6 230 aa28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 DGCR6LQ9BY27 220 aa28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 CNIH4Q9P003 139 aa28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 ABI3Q9P2A4 366 aa28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 WASF3Q9UPY6 502 aa28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 MAN1A2O60476 641 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 LYPD3O95274 346 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 SNAP29O95721 258 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 CASP3P42574 277 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 RBM34P42696 430 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 CCR4P51679 360 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 ALG10BQ5I7T1 473 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 NKAIN4Q8IVV8 208 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 AQP11Q8NBQ7 271 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 PAQR8Q8TEZ7 354 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 C12orf10Q9HB07 376 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 WIF1Q9Y5W5 379 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 OIP5O43482 229 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 UGT2B15P54855 530 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 C1orf94Q6P1W5 598 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 RTL4Q6ZR62 310 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 PARP8Q8N3A8 854 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 CADM2Q8N3J6 435 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 DUSP19Q8WTR2 217 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 SH2D2AQ9NP31 389 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 MSRB2Q9Y3D2 182 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 ANKRD33BA6NCL7 494 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 ITGA3P26006 1051 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 PTGDSP41222 190 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 COX10Q12887 443 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 MED21Q13503 144 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC36A3Q495N2 470 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 TTC23Q5W5X9 447 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC22A10Q63ZE4 541 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 PGBD2Q6P3X8 592 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 PIGXQ8TBF5 258 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 FRMD6Q96NE9 622 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF426Q9BUY5 554 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 TOR3AQ9H497 397 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 GASTP01350 101 aa28.32■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 PNMTP11086 282 aa28.32■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 CAPGP40121 348 aa28.32■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 IDH2P48735 452 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 HLCSP50747 726 aa28.32■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 C6orf52Q5T4I8 152 aa28.32■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 ABHD17BQ5VST6 288 aa28.32■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 ANKRD34AQ69YU3 496 aa28.32■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 CD300LDQ6UXZ3 194 aa28.32■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 LINC00114Q6XXX2 140 aa28.32■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF248Q8NDW4 579 aa28.32■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF563Q8TA94 476 aa28.32■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 WDR70Q9NW82 654 aa28.32■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa28.32■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 GSTM3P21266 225 aa28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 ITPKBP27987 946 aa28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC1A3P43003 542 aa28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF555Q8NEP9 628 aa28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM239Q8WW34 195 aa28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 KCNE4Q8WWG9 221 aa28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 C3orf49Q96BT1 292 aa28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 ANKRD60Q9BZ19 345 aa28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 DPH1Q9BZG8 443 aa28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 STMN3Q9NZ72 180 aa28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 POLHQ9Y253 713 aa28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 HTR3EA5X5Y0 456 aa28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 ANKUB1A6NFN9 424 aa28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 CYB561P49447 251 aa28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 COL28A1Q2UY09 1125 aa28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM255BQ8WV15 326 aa28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 NTNG2Q96CW9 530 aa28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 GABARAPL3Q9BY60 117 aa28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 ANGPTL4Q9BY76 406 aa28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A087WUJ7 227 aa28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 CASRP41180 1078 aa28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 RPS6KA3P51812 740 aa28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 KCNAB2Q13303 367 aa28.29■■■□□ 2.12
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