RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-215	ENST00000583289	AMDHD1	Q96NU7	426 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	LRRC3B	Q96PB8	259 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	MOGAT1	Q96PD6	335 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	CSF3R	Q99062	836 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	MGLL	Q99685	303 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	TREX2	Q9BQ50	279 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	DPH7	Q9BTV6	452 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	TRMT61B	Q9BVS5	477 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	MND1	Q9BWT6	205 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	POLDIP3	Q9BY77	421 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	NXF2	Q9GZY0	626 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	NAA50	Q9GZZ1	169 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	NUAK2	Q9H093	628 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	DCSTAMP	Q9H295	470 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	FZD3	Q9NPG1	666 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	POLE3	Q9NRF9	147 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ZCCHC3	Q9NUD5	404 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	FBXL12	Q9NXK8	326 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF226	Q9NYT6	803 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	TRPC4	Q9UBN4	977 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	SSR3	Q9UNL2	185 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	LRRK1	Q38SD2	2015 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	MN1	Q10571	1320 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	TBC1D3D	A0A087WVF3	549 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	TBC1D3I	A0A087WXS9	549 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	TBC1D3E	A0A087X179	549 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	FUOM	A2VDF0	154 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	AGAP5	A6NIR3	686 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	LRRC72	A6NJI9	287 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	TTC36	A6NLP5	189 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	TBC1D3L	B9A6J9	549 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289		H3BN98	237 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	HMGN4	O00479	90 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	AP3D1	O14617	1153 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	PCDH17	O14917	1159 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	MID1	O15344	667 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	TNFSF14	O43557	240 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	PLRG1	O43660	514 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	SH3BGRL	O75368	114 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	NME6	O75414	186 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	PTTG1	O95997	202 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	PAK4	O96013	591 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	VIP	P01282	170 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	GBA	P04062	536 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	PCCB	P05166	539 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ALPP	P05187	535 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	BCHE	P06276	602 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	IGKV2-30	P06310	120 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	NPS	P0C0P6	89 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC35G6	P0C7Q6	338 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	TBC1D3H	P0C7X1	549 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	GLUL	P15104	373 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	MYL12A	P19105	171 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	CFL1	P23528	166 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ATP5A1	P25705	553 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	4.2	□□□□□ -1.74	3e-8	■■■□□ 15.6
PTPRM-215	ENST00000583289	MPG	P29372	298 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	DRD3	P35462	400 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	OPRL1	P41146	370 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ETV6	P41212	452 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	MAP2K4	P45985	399 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC15A1	P46059	708 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	OR1E2	P47887	323 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	PCYT1A	P49585	367 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	RORC	P51449	518 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	NCBP2	P52298	156 aa	Known RBP eCLIP	4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	MAP2K6	P52564	334 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF134	P52741	427 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	VBP1	P61758	197 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	RIPPLY1	Q0D2K3	151 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	HSPB3	Q12988	150 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	GPR50	Q13585	617 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	SEC23B	Q15437	767 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	SPHAR	Q15513	63 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	CEBPE	Q15744	281 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ETFDH	Q16134	617 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	DECR1	Q16698	335 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	DUSP7	Q16829	419 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	MPEG1	Q2M385	716 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	EIPR1	Q53HC9	387 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF311	Q5JNZ3	666 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	C3orf38	Q5JPI3	329 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ARMC4	Q5T2S8	1044 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	C12orf73	Q69YU5	71 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	TBC1D3C	Q6IPX1	549 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	RPL13AP3	Q6NVV1	102 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC48A1	Q6P1K1	146 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC27A4	Q6P1M0	643 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	HSDL2	Q6YN16	418 aa		4.2	□□□□□ -1.74

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