RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577426.1

TRAPPC8-202, Transcript of trafficking protein particle complex 8, humanhuman

TSL 5

Gene TRAPPC8, Length 437 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8-202ENST00000577426 TUBA1CQ9BQE3 449 aa4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 FAIM2Q9BWQ8 316 aa4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 OSBPL11Q9BXB4 747 aa4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 OR2B2Q9GZK3 357 aa4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 LIME1Q9H400 295 aa4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 GALNT9Q9HCQ5 603 aa4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 EHD3Q9NZN3 535 aa4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 HEY2Q9UBP5 337 aa4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 VPS29Q9UBQ0 182 aa4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 PRODH2Q9UF12 536 aa4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 DCDC2Q9UHG0 476 aa4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 UTS2RQ9UKP6 389 aa4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 GMNCA6NCL1 334 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 B4DXG7 233 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 INAFM1C9JVW0 142 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 G3V2L1 256 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 CBR3O75828 277 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 SUPT7LO94864 414 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 RCBTB2O95199 551 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 GOSR1O95249 250 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 ESRRBO95718 433 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 KRT6AP02538 564 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 KRT6BP04259 564 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 SERPINE1P05121 402 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 ENO1P06733 434 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 IL3P08700 152 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 CYP4B1P13584 511 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 IMPDH1P20839 514 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 DNASE1P24855 282 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 OPRM1P35372 400 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 GCKP35557 465 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 KRT6CP48668 564 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 ALDH9A1P49189 494 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 HTR6P50406 440 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 PRKAA2P54646 552 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 GAS1P54826 345 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 PSPHP78330 225 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 HMGCS1Q01581 520 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 FOXF2Q12947 444 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 EFR3AQ14156 821 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 RCAN2Q14206 197 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 SPIN4Q56A73 249 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 LCE4AQ5TA78 99 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 CGB2Q6NT52 195 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 ENPP6Q6UWR7 440 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 PAMR1Q6UXH9 720 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 NPSR1Q6W5P4 371 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 ZYG11AQ6WRX3 759 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa4.55□□□□□ -1.68
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TRAPPC8-202ENST00000577426 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 MIER2Q8N344 545 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 WDSUB1Q8N9V3 476 aa4.55□□□□□ -1.68
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TRAPPC8-202ENST00000577426 OR14L1PQ8NHC6 308 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 LRRC8CQ8TDW0 803 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 C16orf78Q8WTQ4 265 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 STON2Q8WXE9 905 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 TMBIM1Q969X1 311 aa4.55□□□□□ -1.68
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TRAPPC8-202ENST00000577426 C7orf26Q96N11 449 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 ZFP3Q96NJ6 502 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 COL21A1Q96P44 957 aa4.55□□□□□ -1.68
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TRAPPC8-202ENST00000577426 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 GSTO2Q9H4Y5 243 aa4.55□□□□□ -1.68
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TRAPPC8-202ENST00000577426 TMEM216Q9P0N5 145 aa4.55□□□□□ -1.68
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TRAPPC8-202ENST00000577426 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 STK38LQ9Y2H1 464 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
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