RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561304.5

ZEB1-223, Transcript of zinc finger E-box binding homeobox 1, human

TSL 1 (best)

Gene ZEB1, Length 1,383 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZEB1-223	ENST00000561304	RNF103-CHMP3	A0A140T963	221 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304		C9JVG2	144 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	SCD	O00767	359 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	BIRC5	O15392	142 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	CFLAR	O15519	480 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	CXCL13	O43927	109 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	BCAS1	O75363	584 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	CRH	P06850	196 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	CD1E	P15812	388 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	PRPS1L1	P21108	318 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	LOX	P28300	417 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	SFTPD	P35247	375 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	UGT2B10	P36537	528 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	RPL3	P39023	403 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	CD79B	P40259	229 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	BST1	Q10588	318 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	KLHL26	Q53HC5	615 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	OR2A2	Q6IF42	318 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	PPP4R4	Q6NUP7	873 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	CHMP1B	Q7LBR1	199 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	ZNF610	Q8N9Z0	462 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	GOT1L1	Q8NHS2	421 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	PPP1R14C	Q8TAE6	165 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	PHOSPHO1	Q8TCT1	267 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	ACTRT2	Q8TDY3	377 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	ZBTB8A	Q96BR9	441 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	MARK4	Q96L34	752 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	TEX37	Q96LM6	180 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	DACH2	Q96NX9	599 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	SETD2	Q9BYW2	2564 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	CENPH	Q9H3R5	247 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	COQ10B	Q9H8M1	238 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	ATAD3A	Q9NVI7	634 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	HAO1	Q9UJM8	370 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	ICAM5	Q9UMF0	924 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	EIF3L	Q9Y262	564 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	RAP2C	Q9Y3L5	183 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	6.62	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	PRAMEF27	A3QJZ7	478 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	RNASET2	O00584	256 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	SDHD	O14521	159 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	ADAMDEC1	O15204	470 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	TM9SF1	O15321	606 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	FCMR	O60667	390 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	DIAPH2	O60879	1101 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	ADAM11	O75078	769 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	ALX3	O95076	343 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	NTN1	O95631	604 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	RAF1	P04049	648 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	THBD	P07204	575 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	CD8B	P10966	210 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	POU2F1	P14859	743 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	HPGD	P15428	266 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	PRKCA	P17252	672 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	CD53	P19397	219 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	KLK2	P20151	261 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	ATP6V1C1	P21283	382 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	DNASE1	P24855	282 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	IL12A	P29459	219 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	LCN1	P31025	176 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	RPL14	P50914	215 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	NME5	P56597	212 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	OCRL	Q01968	901 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	SKP2	Q13309	424 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	GPR68	Q15743	365 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	MAPK14	Q16539	360 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	SGCB	Q16585	318 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	SPANXN4	Q5MJ08	99 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	PDZK1	Q5T2W1	519 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	FBXW10	Q5XX13	1052 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	ANKRD34A	Q69YU3	496 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	HBM	Q6B0K9	141 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	FAM214B	Q7L5A3	538 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	C6orf120	Q7Z4R8	191 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	HMGN2P46	Q86SG4	172 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	TGIF2LY	Q8IUE0	185 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	MISP	Q8IVT2	679 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	WDR75	Q8IWA0	830 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	ZNF614	Q8N883	585 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	CHDH	Q8NE62	594 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	OR8J2	Q8NGG1	315 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	OR4A15	Q8NGL6	344 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	OR2V1	Q8NHB1	315 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	RFWD2	Q8NHY2	731 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	FBXO27	Q8NI29	283 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	GPR119	Q8TDV5	335 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	ADAMTS15	Q8TE58	950 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	ROBO4	Q8WZ75	1007 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	ZC3HAV1L	Q96H79	300 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	SLC35G5	Q96KT7	338 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	SDF2	Q99470	211 aa		6.61	□□□□□ -1.35

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.3 ms