RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557168.1

TRAV30-201, Transcript of T cell receptor alpha variable 30, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene TRAV30, Length 337 nt, Biotype TR V gene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV30-201ENST00000557168 CSPG4Q6UVK1 2322 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 A0A0G2JPF8 293 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 TMEM129A0AVI4 362 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 IRGMA1A4Y4 181 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 HYKKA2RU49 373 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 LRIT2A6NDA9 550 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 ANKDD1BA6NHY2 528 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 C5orf58C9J3I9 102 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 PEX12O00623 359 aa4.59□□□□□ -1.67
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TRAV30-201ENST00000557168 ZNF749O43361 778 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 TBX1O43435 398 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 DYRK3O43781 588 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 TMPRSS11DO60235 418 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 TPST2O60704 377 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
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TRAV30-201ENST00000557168 OPN1SWP03999 348 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 ALPPP05187 535 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 UMODP07911 640 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 DBTP11182 482 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 ST6GAL1P15907 406 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 SPNP16150 400 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 CPEP16870 476 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 GSTM3P21266 225 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP4.59□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 MST1P26927 711 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 TNFSF8P32971 234 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 RORAP35398 523 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 PTGER4P35408 488 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 AHRP35869 848 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 TGFBR1P36897 503 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 FOLR3P41439 243 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 RPS5P46782 204 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
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TRAV30-201ENST00000557168 CCT3P49368 545 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
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TRAV30-201ENST00000557168 XKP51811 444 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 NUDT6P53370 316 aa4.59□□□□□ -1.67
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TRAV30-201ENST00000557168 DEFA1P59665 94 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 DEFA3P59666 94 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 CSNK1G2P78368 415 aa4.59□□□□□ -1.67
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TRAV30-201ENST00000557168 ACSM1Q08AH1 577 aa4.59□□□□□ -1.67
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TRAV30-201ENST00000557168 NFE2L1Q14494 772 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 SSPNQ14714 243 aa4.59□□□□□ -1.67
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TRAV30-201ENST00000557168 RPE65Q16518 533 aa4.59□□□□□ -1.67
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TRAV30-201ENST00000557168 DEFB110Q30KQ9 67 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 KLHL22Q53GT1 634 aa4.59□□□□□ -1.67
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TRAV30-201ENST00000557168 OR4C11Q6IEV9 310 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 FAM180AQ6UWF9 173 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 ZER1Q7Z7L7 766 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 LRRTM4Q86VH4 590 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 AMZ2Q86W34 360 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 SNX29P2Q8IUI4 249 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 UBQLNLQ8IYU4 475 aa4.59□□□□□ -1.67
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TRAV30-201ENST00000557168 CLDN22Q8N7P3 220 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 POC5Q8NA72 575 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 CLEC1AQ8NC01 280 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 ZNF485Q8NCK3 441 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 OR4E2Q8NGC2 313 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 OR4D11Q8NGI4 311 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 BBS10Q8TAM1 723 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 SLC7A13Q8TCU3 470 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 HPS1Q92902 700 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 RELTQ969Z4 430 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 MOAP1Q96BY2 351 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 TMEM19Q96HH6 336 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 AMDHD1Q96NU7 426 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 AGAP4Q96P64 663 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 FCRL4Q96PJ5 515 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 SNX18Q96RF0 628 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 ARHGDIGQ99819 225 aa4.59□□□□□ -1.67
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