RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 CCR4P51679 360 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 HMGA2P52926 109 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 KCNAB2Q13303 367 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 RAPSNQ13702 412 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 DGCR6Q14129 220 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 TRAM2Q15035 370 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 CD226Q15762 336 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 ENTPD8Q5MY95 495 aa8.49□□□□□ -1.05
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CS-220ENST00000550700 GRINAQ7Z429 371 aa8.49□□□□□ -1.05
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CS-220ENST00000550700 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 SVOPLQ8N434 492 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 FADS6Q8N9I5 356 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
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CS-220ENST00000550700 OR2M3Q8NG83 312 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
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CS-220ENST00000550700 PYDC1Q8WXC3 89 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 SLC38A4Q969I6 547 aa8.49□□□□□ -1.05
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CS-220ENST00000550700 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 EPYCQ99645 322 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 SLC19A3Q9BZV2 496 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 VCX3BQ9H321 246 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 PRORYQ9H606 182 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 ACER3Q9NUN7 267 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 ANKRD10Q9NXR5 420 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 PLA2G3Q9NZ20 509 aa8.49□□□□□ -1.05
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CS-220ENST00000550700 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 CHST2Q9Y4C5 530 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 V9GYQ6 96 aa8.49□□□□□ -1.05
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CS-220ENST00000550700 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa8.48□□□□□ -1.05
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CS-220ENST00000550700 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 A0A1B0GX12 115 aa8.48□□□□□ -1.05
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CS-220ENST00000550700 hCG_2039718K7EN88 272 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 M0R3H8 397 aa8.48□□□□□ -1.05
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CS-220ENST00000550700 E2F6O75461 281 aa8.48□□□□□ -1.05
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CS-220ENST00000550700 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 ZNF136P52737 540 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP8.48□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 VLDLRP98155 873 aa8.48□□□□□ -1.05
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CS-220ENST00000550700 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 SLC25A53Q5H9E4 307 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 ALG10BQ5I7T1 473 aa8.48□□□□□ -1.05
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CS-220ENST00000550700 HIPK1Q86Z02 1210 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 SULF2Q8IWU5 870 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 CDK20Q8IZL9 346 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 PQLC1Q8N2U9 271 aa8.48□□□□□ -1.05
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CS-220ENST00000550700 PIGQQ9BRB3 760 aa8.48□□□□□ -1.05
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CS-220ENST00000550700 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 GALNT9Q9HCQ5 603 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 TAS2R10Q9NYW0 307 aa8.48□□□□□ -1.05
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