RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541990.5

THBS3-211, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS3, Length 2,928 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-211ENST00000541990 ASZ1Q8WWH4 475 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 XAGE5Q8WWM1 108 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 THAP4Q8WY91 577 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 HGDQ93099 445 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 NEURL3Q96EH8 262 aa8.49□□□□□ -1.05
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THBS3-211ENST00000541990 CACNG6Q9BXT2 260 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 HDAC8Q9BY41 377 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 WDR26Q9H7D7 661 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 MED20Q9H944 212 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 A4GALTQ9NPC4 353 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 HCN3Q9P1Z3 774 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 LIPT1Q9Y234 373 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 SPAG17Q6Q759 2223 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 A0A0G2JN53 185 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 A0A1W2PRQ8 180 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 BET1O15155 118 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 RNF13O43567 381 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 SLCO2B1O94956 709 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 CXCL2P19875 107 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 PRLHRP49683 370 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 MANFP55145 182 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 DMWDQ09019 674 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 ZNF273Q14593 569 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 SLC27A4Q6P1M0 643 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 C1orf94Q6P1W5 598 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 RPTNQ6XPR3 784 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 OAFQ86UD1 273 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 BBS10Q8TAM1 723 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 TEX47Q8TBZ9 253 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 OR2M2Q96R28 347 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 TIMP4Q99727 224 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 TTTY10Q9BZA0 68 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 BRD7Q9NPI1 651 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 A0A0G2JK05 382 aa8.48□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 PPM1DO15297 605 aa8.48□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 SERPINI2O75830 405 aa8.48□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 ALDOBP05062 364 aa8.48□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP8.48□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 TNFRSF4P43489 277 aa8.48□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 MAPK9P45984 424 aa8.48□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 GPR4P46093 362 aa8.48□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 TSPAN5P62079 268 aa8.48□□□□□ -1.05
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THBS3-211ENST00000541990 COL19A1Q14993 1142 aa8.48□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
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THBS3-211ENST00000541990 HBMQ6B0K9 141 aa8.48□□□□□ -1.05
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THBS3-211ENST00000541990 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa8.48□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 SHISA5Q8N114 240 aa8.48□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 KLHL36Q8N4N3 616 aa8.48□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 TBC1D19Q8N5T2 526 aa8.48□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 TMEM99Q8N816 258 aa8.48□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 AMER3Q8N944 861 aa8.48□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 POGLUT1Q8NBL1 392 aa8.48□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 GABRG3Q99928 467 aa8.48□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 TMEM168Q9H0V1 697 aa8.48□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 ISYNA1Q9NPH2 558 aa8.48□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 KLHL1Q9NR64 748 aa8.48□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 CA10Q9NS85 328 aa8.48□□□□□ -1.05
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THBS3-211ENST00000541990 SPATA2Q9UM82 520 aa8.48□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 MAB21L2Q9Y586 359 aa8.48□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 SLC5A10A0PJK1 596 aa8.48□□□□□ -1.05
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THBS3-211ENST00000541990 GMDSO60547 372 aa8.48□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 LPLP06858 475 aa8.48□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 CHRM4P08173 479 aa8.48□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 ADRB1P08588 477 aa8.48□□□□□ -1.05
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THBS3-211ENST00000541990 PCSK2P16519 638 aa8.48□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 FUT1P19526 365 aa8.48□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 KELP23276 732 aa8.48□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 BLVRAP53004 296 aa8.48□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 KIAA1024LP59773 190 aa8.48□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 ZNF33BQ06732 778 aa8.48□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 FUT5Q11128 374 aa8.48□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 MELKQ14680 651 aa8.48□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 AADACL4Q5VUY2 407 aa8.48□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 LRFN4Q6PJG9 635 aa8.48□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 ARL9Q6T311 187 aa8.48□□□□□ -1.05
THBS3-211ENST00000541990 TOMM5Q8N4H5 51 aa8.48□□□□□ -1.05
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