RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533179.1

SOX9-AS1-211, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 460 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-211ENST00000533179 POPDC2Q9HBU9 364 aa6.57□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 C20orf141Q9NUB4 165 aa6.57□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TAS2R14Q9NYV8 317 aa6.57□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa6.57□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DKKL1Q9UK85 242 aa6.57□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 B9D1Q9UPM9 204 aa6.57□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SLC7A11Q9UPY5 501 aa6.57□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CTNND2Q9UQB3 1225 aa6.57□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PDE10AQ9Y233 779 aa6.57□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MYRFQ9Y2G1 1151 aa6.57□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZNF609O15014 1411 aa6.57□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 C9orf84Q5VXU9 1444 aa6.57□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CROCC2H7BZ55 1655 aa6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TMEM89A2RUT3 159 aa6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 E9PQ18 207 aa6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SDHDO14521 159 aa6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DSCR3O14972 297 aa6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SIVA1O15304 175 aa6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 LAMTOR5O43504 91 aa6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 LDB2O43679 373 aa6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SYNGR3O43761 229 aa6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TPST2O60704 377 aa6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PMPCBO75439 489 aa6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SCGNO76038 276 aa6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FMO4P31512 558 aa6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PRDX2P32119 198 aa6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GPR143P51810 404 aa6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CRYBA4P53673 196 aa6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RAP2BP61225 183 aa6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ADORA2A-AS1P86434 159 aa6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MESP2Q0VG99 397 aa6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 IKZF1Q13422 519 aa6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CRMP1Q14194 572 aa6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 KIR3DS1Q14943 382 aa6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SPA17Q15506 151 aa6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 C14orf28Q4W4Y0 310 aa6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 AGKQ53H12 422 aa6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 NKAPLQ5M9Q1 402 aa6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 LYSMD4Q5XG99 296 aa6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FBXW9Q5XUX1 488 aa6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RNF43Q68DV7 783 aa6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OR2A2Q6IF42 318 aa6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TEPPQ6URK8 271 aa6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TMEM179Q6ZVK1 233 aa6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 IL17RELQ6ZVW7 336 aa6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PELI3Q8N2H9 469 aa6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PRSS35Q8N3Z0 413 aa6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FAM46DQ8NEK8 389 aa6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OR1L4Q8NGR5 311 aa6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OR4A16Q8NH70 328 aa6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TMEM163Q8TC26 289 aa6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TMEM234Q8WY98 164 aa6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PIK3R3Q92569 461 aa6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CREB3L1Q96BA8 519 aa6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SFRP2Q96HF1 295 aa6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 EBF4Q9BQW3 602 aa6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TTYH2Q9BSA4 534 aa6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ALG8Q9BVK2 526 aa6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ACTR6Q9GZN1 396 aa6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 EGLN3Q9H6Z9 239 aa6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TPT1P8Q9HAU6 139 aa6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GPR35Q9HC97 309 aa6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 NIT2Q9NQR4 276 aa6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SMOXQ9NWM0 555 aa6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PIPOXQ9P0Z9 390 aa6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 KLQ9UEF7 1012 aa6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 NUDT5Q9UKK9 219 aa6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RNF150Q9ULK6 438 aa6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ICAM5Q9UMF0 924 aa6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MEMO1Q9Y316 297 aa6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 BCL9O00512 1426 aa6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 AK9Q5TCS8 1911 aa6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GJE1A6NN92 205 aa6.55□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OR11H12B2RN74 326 aa6.55□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 HHLA1C9JL84 531 aa6.55□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 I6L893 689 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RGS11O94810 467 aa6.55□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RAB40ALP0C0E4 278 aa6.55□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms