RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524238.3

HMBOX1-211, Transcript of homeobox containing 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HMBOX1, Length 1,731 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1-211ENST00000524238 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa7□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 UNC119BA6NIH7 251 aa7□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 RIIAD1A6NNX1 92 aa7□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 LGALS8O00214 317 aa7□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 PLPP1O14494 284 aa7□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 GNB5O14775 395 aa7□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 GRM6O15303 877 aa7□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 OGG1O15527 345 aa7□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 SBK2P0C263 348 aa7□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 NAT2P11245 290 aa7□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 EPCAMP16422 314 aa7□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 ATF1P18846 271 aa7□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 BSGP35613 385 aa7□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 RAD52P43351 418 aa7□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 STARP49675 285 aa7□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 RAB13P51153 203 aa7□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 TAS2R38P59533 333 aa7□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 STX4Q12846 297 aa7□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 GPR68Q15743 365 aa7□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 CCSMST1Q4G0I0 132 aa7□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 EIPR1Q53HC9 387 aa7□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 ARSIQ5FYB1 569 aa7□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 IER5LQ5T953 404 aa7□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 TPGS2Q68CL5 300 aa7□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 OR5M10Q6IEU7 315 aa7□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 SLC8B1Q6J4K2 584 aa7□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 PLBD1Q6P4A8 553 aa7□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 CXCL17Q6UXB2 119 aa7□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 DLK2Q6UY11 383 aa7□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 GDPD4Q6W3E5 623 aa7□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 Q6ZNB5 142 aa7□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 SZRD1Q7Z422 152 aa7□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 C17orf64Q86WR6 236 aa7□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 NRSN1Q8IZ57 195 aa7□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 ARMC10Q8N2F6 343 aa7□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 LNX2Q8N448 690 aa7□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 CCDC107Q8WV48 283 aa7□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 SOCS4Q8WXH5 440 aa7□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 THAP4Q8WY91 577 aa7□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 EDAQ92838 391 aa7□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 RAD51AP1Q96B01 352 aa7□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 SMIM19Q96E16 107 aa7□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 SLC41A3Q96GZ6 507 aa7□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 C4orf36Q96KX1 117 aa7□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 ART5Q96L15 291 aa7□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 PGLYRP3Q96LB9 341 aa7□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 BBS4Q96RK4 519 aa7□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 CD180Q99467 661 aa7□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 MFFQ9GZY8 342 aa7□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 FXYD6Q9H0Q3 95 aa7□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 UBQLN3Q9H347 655 aa7□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa7□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 BEX1Q9HBH7 125 aa7□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 FANCFQ9NPI8 374 aa7□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 CMC2Q9NRP2 79 aa7□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 GPR160Q9UJ42 338 aa7□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa6.99□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 A0A1B0GVC2 190 aa6.99□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa6.99□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 A6NIN4 97 aa6.99□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 RFPL4AA6NLU0 287 aa6.99□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 DUXAA6NLW8 204 aa6.99□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 WASH3PC4AMC7 463 aa6.99□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa6.99□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 J3QLW9 94 aa6.99□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 KIAA0355O15063 1070 aa6.99□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 YKT6O15498 198 aa6.99□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 ADAM12O43184 909 aa6.99□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 HOXA2O43364 376 aa6.99□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 MTX2O75431 263 aa6.99□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 ATG12O94817 140 aa6.99□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 EPPINO95925 133 aa6.99□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 IFNGP01579 166 aa6.99□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 RPN2P04844 631 aa6.99□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 S100A8P05109 93 aa6.99□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 CHRM4P08173 479 aa6.99□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 CSF1P09603 554 aa6.99□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF19P17023 458 aa6.99□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF3P17036 446 aa6.99□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 RPL17P18621 184 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 MPGP29372 298 aa6.99□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 PREPP48147 710 aa6.99□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 MEOX2P50222 304 aa6.99□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 ART1P52961 327 aa6.99□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms