RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503638.1

PGGT1B-204, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 579 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-204ENST00000503638 SVILO95425 2214 aa12.15□□□□□ -0.46
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PGGT1B-204ENST00000503638 CFAP73A6NFT4 308 aa12.14□□□□□ -0.47
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PGGT1B-204ENST00000503638 AQP7O14520 342 aa12.14□□□□□ -0.47
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PGGT1B-204ENST00000503638 NCKAP5O14513 1909 aa12.12□□□□□ -0.47
PGGT1B-204ENST00000503638 OR2M5A3KFT3 312 aa12.12□□□□□ -0.47
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PGGT1B-204ENST00000503638 MFN2O95140 757 aa12.12□□□□□ -0.47
PGGT1B-204ENST00000503638 ACTL6AO96019 429 aa12.12□□□□□ -0.47
PGGT1B-204ENST00000503638 OPN1LWP04000 364 aa12.12□□□□□ -0.47
PGGT1B-204ENST00000503638 T-ENOLP0DO92 83 aa12.12□□□□□ -0.47
PGGT1B-204ENST00000503638 BMP7P18075 431 aa12.12□□□□□ -0.47
PGGT1B-204ENST00000503638 CCNA2P20248 432 aa12.12□□□□□ -0.47
PGGT1B-204ENST00000503638 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
PGGT1B-204ENST00000503638 STARP49675 285 aa12.12□□□□□ -0.47
PGGT1B-204ENST00000503638 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
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