RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493752.5

ABCD4-216, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, humanhuman

TSL 3

Gene ABCD4, Length 719 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD4-216ENST00000493752 CD247P20963 164 aa7.37□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 CHMP24386 653 aa7.37□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 RYKP34925 604 aa7.37□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 GCKP35557 465 aa7.37□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 CCR4P51679 360 aa7.37□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 GFRA1P56159 465 aa7.37□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 B3GALT5-AS1P59052 145 aa7.37□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 COPZ1P61923 177 aa7.37□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 TLE1Q04724 770 aa7.37□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 EPS8Q12929 822 aa7.37□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 QPRTQ15274 297 aa7.37□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 BCL2A1Q16548 175 aa7.37□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP7.37□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 PLPPR5Q32ZL2 321 aa7.37□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 SLC25A53Q5H9E4 307 aa7.37□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 VASNQ6EMK4 673 aa7.37□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 AAGABQ6PD74 315 aa7.37□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 GFRALQ6UXV0 394 aa7.37□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 CBLL1Q75N03 491 aa7.37□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 EID3Q8N140 333 aa7.37□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa7.37□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 FAM156AQ8NDB6 213 aa7.37□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa7.37□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 GPR32P1Q8NGA4 272 aa7.37□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 ZNF563Q8TA94 476 aa7.37□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 ST8SIA1Q92185 356 aa7.37□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 PROX1Q92786 737 aa7.37□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 FAM162AQ96A26 154 aa7.37□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 MIB2Q96AX9 1013 aa7.37□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 MRGPRX4Q96LA9 322 aa7.37□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 RNF145Q96MT1 663 aa7.37□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 LRMDAQ9H2I8 198 aa7.37□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 MUC13Q9H3R2 512 aa7.37□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 EXO5Q9H790 373 aa7.37□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 ACER3Q9NUN7 267 aa7.37□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 ACTR3BQ9P1U1 418 aa7.37□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 EGFL7Q9UHF1 273 aa7.37□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 RPS6KA6Q9UK32 745 aa7.37□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 SNX13Q9Y5W8 968 aa7.37□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 NAV2Q8IVL1 2488 aa7.36□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 OR2M5A3KFT3 312 aa7.36□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 AP3D1O14617 1153 aa7.36□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 FMO6PO60774 539 aa7.36□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 NTN1O95631 604 aa7.36□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 SERPINA1P01009 418 aa7.36□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 GKN3PP0CG01 181 aa7.36□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 GP1BBP13224 206 aa7.36□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 PRG2P13727 222 aa7.36□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 ZNF17P17021 662 aa7.36□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 PRKCAP17252 672 aa7.36□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 BMP7P18075 431 aa7.36□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 PTGS2P35354 604 aa7.36□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 SLC1A3P43003 542 aa7.36□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 HTR3AP46098 478 aa7.36□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 IDH2P48735 452 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 MAP2K6P52564 334 aa7.36□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 ZNF136P52737 540 aa7.36□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 SESN3P58005 492 aa7.36□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 FOXK1P85037 733 aa7.36□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 MS4A2Q01362 244 aa7.36□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 RBPJQ06330 500 aa7.36□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 NRF1Q16656 503 aa7.36□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa7.36□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 RAET1LQ5VY80 246 aa7.36□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 WBP2NLQ6ICG8 309 aa7.36□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 ASRGL1Q7L266 308 aa7.36□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa7.36□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 GRINAQ7Z429 371 aa7.36□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 COMTD1Q86VU5 262 aa7.36□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 DHFR2Q86XF0 187 aa7.36□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 SPPL2CQ8IUH8 684 aa7.36□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 LSMEM1Q8N8F7 131 aa7.36□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 GALNT11Q8NCW6 608 aa7.36□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 POC1BQ8TC44 478 aa7.36□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 MCUR1Q96AQ8 359 aa7.36□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 SARAFQ96BY9 339 aa7.36□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 ZNF524Q96C55 264 aa7.36□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 ASB9Q96DX5 294 aa7.36□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 CLPTM1LQ96KA5 538 aa7.36□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 NSMCE2Q96MF7 247 aa7.36□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 SFXN2Q96NB2 322 aa7.36□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 TIMP4Q99727 224 aa7.36□□□□□ -1.23
ABCD4-216ENST00000493752 ARHGDIGQ99819 225 aa7.36□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms