RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492417.5

TRA2B-215, Transcript of transformer 2 beta homolog, human

TSL 1 (best)

Gene TRA2B, Length 4,141 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRA2B-215	ENST00000492417	IL20RA	Q9UHF4	553 aa		4.15	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		4.15	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	LIPT1	Q9Y234	373 aa		4.15	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	ICE1	Q9Y2F5	2266 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	C12orf71	A8MTZ7	269 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	NPIPA5	E9PKD4	350 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	SOX14	O95416	240 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	PRG2	P13727	222 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	NAT1	P18440	290 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	ACP1	P24666	158 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	DNASE1L1	P49184	302 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	CASP6	P55212	293 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	MC2R	Q01718	297 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	CFHR1	Q03591	330 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	CD47	Q08722	323 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	GAB1	Q13480	694 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	SMCO1	Q147U7	214 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	DUSP5	Q16690	384 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	SPRED3	Q2MJR0	410 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	ZNF800	Q2TB10	664 aa	Predicted RBP eCLIP	4.15	□□□□□ -1.75	1e-7	■■■■■ 32.6
TRA2B-215	ENST00000492417	C11orf91	Q3C1V1	193 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	TBRG1	Q3YBR2	411 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	XKR7	Q5GH72	579 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	SLC35F1	Q5T1Q4	408 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	CARD17	Q5XLA6	110 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	YRDC	Q86U90	279 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	LNX2	Q8N448	690 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	SLC38A9	Q8NBW4	561 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	TMEM52	Q8NDY8	209 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	DNAJB8	Q8NHS0	232 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	HMGCLL1	Q8TB92	370 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	TNFAIP8L1	Q8WVP5	186 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	TRUB1	Q8WWH5	349 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	C10orf90	Q96M02	699 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	TRIM2	Q9C040	744 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	OR51V1	Q9H2C8	321 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	DSN1	Q9H410	356 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	AMBN	Q9NP70	447 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	AASS	Q9UDR5	926 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	NPIPA1	Q9UND3	350 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	PCDHGA1	Q9Y5H4	931 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	NPFFR2	Q9Y5X5	522 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	ZNF891	A8MT65	544 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	HRK	O00198	91 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	XKRY	O14609	159 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	TOX3	O15405	576 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	CRYZL1	O95825	349 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	PNLIP	P16233	465 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	PGC	P20142	388 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	DNAJA1	P31689	397 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	DCT	P40126	519 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	EIF1AX	P47813	144 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	CD97	P48960	835 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	PCDH1	Q08174	1060 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	TAF13	Q15543	124 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	NPTX1	Q15818	432 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	EXT1	Q16394	746 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	ZNF404	Q494X3	552 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	GALNT16	Q8N428	558 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	PACRGL	Q8N7B6	248 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	TOR1AIP2	Q8NFQ8	470 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	OR2Y1	Q8NGV0	311 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	PIGX	Q8TBF5	258 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	TEX47	Q8TBZ9	253 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	NT5C	Q8TCD5	201 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	TMEM234	Q8WY98	164 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	EXTL1	Q92935	676 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	SLC7A6OS	Q96CW6	309 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	FRMD6	Q96NE9	622 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	OR5B2	Q96R09	309 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	MENT	Q9BUN1	341 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	IFT27	Q9BW83	186 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	OR2B2	Q9GZK3	357 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	MTHFD2L	Q9H903	347 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	SNTG1	Q9NSN8	517 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	ACSS1	Q9NUB1	689 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	PAQR5	Q9NXK6	330 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	MALT1	Q9UDY8	824 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	BTNL2	Q9UIR0	455 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	CLEC4A	Q9UMR7	237 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	CAMK2A	Q9UQM7	478 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	ASB4	Q9Y574	426 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417		A0A0A6YYD5	115 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	AQP12B	A6NM10	295 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	CLDN24	A6NM45	220 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	ZNF726	A6NNF4	738 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	FAM25E	A8MYX2	175 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	SLC30A4	O14863	429 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	SLC22A2	O15244	555 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	FCMR	O60667	390 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	DDAH2	O95865	285 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	H1F0	P07305	194 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	ADORA3	P0DMS8	318 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TRA2B-215	ENST00000492417	CD1E	P15812	388 aa		4.14	□□□□□ -1.75

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