RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, human

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC43A2	Q8N370	569 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF615	Q8N8J6	731 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	SIMC1	Q8NDZ2	872 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	OR7G1	Q8NGA0	311 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	OR4K5	Q8NGD3	323 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	WDR36	Q8NI36	951 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	RAB2B	Q8WUD1	216 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	GAB3	Q8WWW8	586 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	ACOT11	Q8WXI4	607 aa	Predicted RBP	5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	SGCD	Q92629	289 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	FCGR1B	Q92637	280 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	CDS1	Q92903	461 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC38A4	Q969I6	547 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	ZG16B	Q96DA0	208 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	DPYSL5	Q9BPU6	564 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	FNDC11	Q9BVV2	318 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	CDCA4	Q9BXL8	241 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	POLDIP3	Q9BY77	421 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	ADNP	Q9H2P0	1102 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF768	Q9H5H4	540 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	PRTFDC1	Q9NRG1	225 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	C14orf105	Q9NVL8	296 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	LRIT1	Q9P2V4	623 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	TES	Q9UGI8	421 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	ENPP5	Q9UJA9	477 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	PILRB	Q9UKJ0	227 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	CDC14A	Q9UNH5	594 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	SNX5	Q9Y5X3	404 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	IGLV3-12	A0A075B6K2	115 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	LY6G6E	A0A0G2JKS1	128 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A1B0GVT2	93 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	HTR3E	A5X5Y0	456 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	EFCAB10	A6NFE3	127 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF99	A8MXY4	864 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247		H3BMQ9	156 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	AP3D1	O14617	1153 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	DSCR3	O14972	297 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	XPNPEP2	O43895	674 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	OR10H2	O60403	315 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	OR10H3	O60404	316 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	PRAMEF2	O60811	474 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	NME6	O75414	186 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	KCNK2	O95069	426 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	APOL3	O95236	402 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	MPIG6B	O95866	241 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	IGF2	P01344	180 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	MT-ND2	P03891	347 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	CLPS	P04118	112 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	THY1	P04216	161 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	IGKV3-11	P04433	115 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	DCN	P07585	359 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	CYC1	P08574	325 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	CT45A8	P0DMV1	189 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	CT45A9	P0DMV2	189 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	GNS	P15586	552 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	BMP7	P18075	431 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	DRD5	P21918	477 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	MMP11	P24347	488 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	EEF1B2	P24534	225 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	PCSK6	P29122	969 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	ALDH4A1	P30038	563 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	FMO3	P31513	532 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	IFNA8	P32881	189 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	CSF2RB	P32927	897 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	ARRB1	P49407	418 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	LIMK1	P53667	647 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	RGS8	P57771	180 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	OR1D5	P58170	312 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	PSPH	P78330	225 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	CDK5	Q00535	292 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	PSG6	Q00889	435 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	SIGLEC14	Q08ET2	396 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	RTP5	Q14D33	572 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	MAPK14	Q16539	360 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	DEFB110	Q30KQ9	67 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	PLK5	Q496M5	336 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	CT45A2	Q5DJT8	189 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	CT83	Q5H943	113 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	FGD3	Q5JSP0	725 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	PHF19	Q5T6S3	580 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	MEDAG	Q5VYS4	303 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF613	Q6PF04	617 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	C19orf48	Q6RUI8	117 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF836	Q6ZNA1	936 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	DGAT2L6	Q6ZPD8	337 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	MBOAT2	Q6ZWT7	520 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	SZRD1	Q7Z422	152 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	ARHGAP22	Q7Z5H3	698 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	RABEPK	Q7Z6M1	372 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM151B	Q8IW70	566 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	DEFB123	Q8N688	67 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	DEFB119	Q8N690	84 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	LSMEM1	Q8N8F7	131 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		5.11	□□□□□ -1.59

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.9 ms