RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477812.1

ACTB-210, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 2

Gene ACTB, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-210ENST00000477812 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 CCR4P51679 360 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 SLC10A1Q14973 349 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 QPRTQ15274 297 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 NPTX1Q15818 432 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 SPPL2CQ8IUH8 684 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 LACC1Q8IV20 430 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 EID3Q8N140 333 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 FAM86B1Q8N7N1 296 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 SLC26A7Q8TE54 656 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 GPR137Q96N19 417 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 DEFB127Q9H1M4 99 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 SLC6A15Q9H2J7 730 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 TAS2R10Q9NYW0 307 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 SLC7A8Q9UHI5 535 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 DKKL1Q9UK85 242 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 BAG5Q9UL15 447 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 A0A1B0GVC2 190 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 M0R3H8 397 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 TPST2O60704 377 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 TRAPPC6AO75865 159 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 PRKCAP17252 672 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 RYKP34925 604 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 SLC25A53Q5H9E4 307 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 TRILQ7L0X0 811 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 ZNF550Q7Z398 422 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 VTCN1Q7Z7D3 282 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 POC1BQ8TC44 478 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 CPT1CQ8TCG5 803 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 MCUR1Q96AQ8 359 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 DTNBP1Q96EV8 351 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 EVA1AQ9H8M9 152 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 ADPRHL2Q9NX46 363 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 VDAC3Q9Y277 283 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 FREM3P0C091 2139 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 MED12Q93074 2177 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 TCRBV5S2A0A599 114 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 SHISA8B8ZZ34 492 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 B8ZZF3 427 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 NUDT14O95848 222 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 HK1P19367 917 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 PGCP20142 388 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 TNFRSF1BP20333 461 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 HTR2AP28223 471 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 GFRA1P56159 465 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 HOXC5Q00444 222 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 FOXF1Q12946 379 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 ZSCAN26Q16670 478 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 FGD2Q7Z6J4 655 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 OR6T1Q8NGN1 323 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 OR14L1PQ8NHC6 308 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 NEIL3Q8TAT5 605 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 ST8SIA1Q92185 356 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 ZBTB8AQ96BR9 441 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 TPD52L3Q96J77 140 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 NSMCE2Q96MF7 247 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 ACER3Q9NUN7 267 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 KLHL28Q9NXS3 571 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 RPS6KA6Q9UK32 745 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 POMPQ9Y244 141 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 SVILO95425 2214 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 DNAJC13O75165 2243 aa18.05■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa18.05■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 SUSD5O60279 629 aa18.05■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 HCN1O60741 890 aa18.05■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 SEMA7AO75326 666 aa18.05■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 GMNNO75496 209 aa18.05■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 ZNF682O95780 498 aa18.05■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 SEMG1P04279 462 aa18.05■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 ZNF17P17021 662 aa18.05■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 IDH2P48735 452 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 SESN3P58005 492 aa18.05■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 TOMM20Q15388 145 aa18.05■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 KRTCAP3Q53RY4 240 aa18.05■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 ENPP6Q6UWR7 440 aa18.05■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 CYP2R1Q6VVX0 501 aa18.05■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 CARM1Q86X55 608 aa18.05■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 DHFR2Q86XF0 187 aa18.05■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 PROX1Q92786 737 aa18.05■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 HSH2DQ96JZ2 352 aa18.05■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 SPRR3Q9UBC9 169 aa18.05■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
ACTB-210ENST00000477812 SLC13A4Q9UKG4 626 aa18.05■□□□□ 0.48
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