RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471364.1

RUBCN-208, Transcript of RUN and cysteine rich domain containing beclin 1 interacting protein, human

TSL 3

Gene RUBCN, Length 434 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RUBCN-208	ENST00000471364	TRBV4-1	A0A0J9YWV2	114 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364		A0A1W2PQ72	361 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	ARRDC5	A6NEK1	342 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	HRK	O00198	91 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	WDPCP	O95876	746 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	CLPTM1	O96005	669 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	AK1	P00568	194 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	F10	P00742	488 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	TFAP2A	P05549	437 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	H1F0	P07305	194 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	HEXB	P07686	556 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	ICAM2	P13598	275 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	AGA	P20933	346 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	CBL	P22681	906 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	MST1	P26927	711 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	SSTR2	P30874	369 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	GABRA3	P34903	492 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	RYK	P34925	604 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	RPL5	P46777	297 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	SMS	P52788	366 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	CDH15	P55291	814 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	ISL1	P61371	349 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	POU6F2	P78424	691 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	CD47	Q08722	323 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	NPRL3	Q12980	569 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	MEP1A	Q16819	746 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	CTU2	Q2VPK5	515 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	ABHD17B	Q5VST6	288 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	ZNF836	Q6ZNA1	936 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	LAPTM4B	Q86VI4	370 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	TSPYL5	Q86VY4	417 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	TAGAP	Q8N103	731 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	ZNF619	Q8N2I2	560 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	GPR151	Q8TDV0	419 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	PHF10	Q8WUB8	498 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	FBLIM1	Q8WUP2	373 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	RIT1	Q92963	219 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	RBM18	Q96H35	190 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	PITX2	Q99697	317 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	NIPSNAP1	Q9BPW8	284 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	PELO	Q9BRX2	385 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	FUZ	Q9BT04	418 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	SAP130	Q9H0E3	1048 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	MTHFD2L	Q9H903	347 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	NMNAT1	Q9HAN9	279 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	FBXO34	Q9NWN3	711 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	TMCC3	Q9ULS5	477 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	ZNF443	Q9Y2A4	671 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	POFUT2	Q9Y2G5	429 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	GPR55	Q9Y2T6	319 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	IFT52	Q9Y366	437 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	MMACHC	Q9Y4U1	282 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	GMPPB	Q9Y5P6	360 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364		A0A087WXM4	84 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	OR5H15	A6NDH6	313 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	FAAH	O00519	579 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	PRAMEF2	O60811	474 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	OXSR1	O95747	527 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	IL7R	P16871	459 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	RPS4Y1	P22090	263 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	EPHA2	P29317	976 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	SSTR4	P31391	388 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	GALNS	P34059	522 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	EMD	P50402	254 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	RPS6KA3	P51812	740 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	SMIM11A	P58511	58 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	TUBA4A	P68366	448 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	BIK	Q13323	160 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	DSG2	Q14126	1118 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	SERTAD2	Q14140	314 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	SEC23B	Q15437	767 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	GPR68	Q15743	365 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	LIN52	Q52LA3	116 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	FGD3	Q5JSP0	725 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	RBM48	Q5RL73	367 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	DCST1	Q5T197	706 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	FAAH2	Q6GMR7	532 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	ZNF770	Q6IQ21	691 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	LAIR2	Q6ISS4	152 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	SETD9	Q8NE22	299 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	HDAC2	Q92769	488 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	PRRC1	Q96M27	445 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	OR1F2P	Q96R84	312 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	ZNF700	Q9H0M5	742 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	MKKS	Q9NPJ1	570 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	STMN3	Q9NZ72	180 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	TEKT2	Q9UIF3	430 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	SLC13A4	Q9UKG4	626 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	HSPE1-MOB4	S4R3N1	261 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	LOC102723996	A0A087X1L8	192 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RUBCN-208	ENST00000471364	NPIPA5	A0A0B4J1W7	369 aa		11.61	□□□□□ -0.55

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