RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469529.6

TRAF4-208, Transcript of TNF receptor associated factor 4, human

TSL 2

Gene TRAF4, Length 788 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAF4-208	ENST00000469529	PGC	P20142	388 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	IFNGR2	P38484	337 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC1A3	P43003	542 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	CYB561	P49447	251 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	TAS2R41	P59536	307 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	COPZ1	P61923	177 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	GANAB	Q14697	944 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	EXOC3L2	Q2M3D2	409 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	CMPK2	Q5EBM0	449 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	NHSL2	Q5HYW2	709 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	ABHD17B	Q5VST6	288 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	C1orf94	Q6P1W5	598 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	CBLN3	Q6UW01	205 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	LRRC69	Q6ZNQ3	347 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	RTL4	Q6ZR62	310 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	PLEKHM3	Q6ZWE6	761 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	GDF7	Q7Z4P5	450 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF614	Q8N883	585 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	OR10G3	Q8NGC4	313 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	GPR119	Q8TDV5	335 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	KCNE4	Q8WWG9	221 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	OSBPL11	Q9BXB4	747 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC19A3	Q9BZV2	496 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	PDP1	Q9P0J1	537 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	ABI3	Q9P2A4	366 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	RAB26	Q9ULW5	256 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	MGAT4B	Q9UQ53	548 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	CARD8	Q9Y2G2	431 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529		U3KQV3	271 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	CHD6	Q8TD26	2715 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM208B	Q5VWN6	2430 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529		A0A087WUJ7	227 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529		A0A087WUU8	490 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	TRBV4-1	A0A0J9YWV2	114 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529		A0A1B0GWA3	101 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529		H0YAE9	185 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	EI24	O14681	340 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	DENR	O43583	198 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	HCRTR2	O43614	444 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	CHP2	O43745	196 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	CEACAM4	O75871	244 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	ADA	P00813	363 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	PNMT	P11086	282 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	CBL	P22681	906 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	DAP	P51397	102 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	HOXC5	Q00444	222 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF117	Q03924	483 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	LRRC36	Q1X8D7	754 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC25A53	Q5H9E4	307 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	PODNL1	Q6PEZ8	512 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	IGFL2	Q6UWQ7	119 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	IL20RB	Q6UXL0	311 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	IZUMO2	Q6UXV1	221 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	MBOAT2	Q6ZWT7	520 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	VASH2	Q86V25	355 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF227	Q86WZ6	799 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	PARP8	Q8N3A8	854 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	OR10G2	Q8NGC3	310 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	TFAP2C	Q92754	450 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	HAS2	Q92819	552 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM41A	Q96HV5	264 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	FEV	Q99581	238 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	PRR14	Q9BWN1	585 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	ING2	Q9H160	280 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	PROK2	Q9HC23	129 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	HPF1	Q9NWY4	346 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	SMPD3	Q9NY59	655 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	ENOPH1	Q9UHY7	261 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	MAGED1	Q9Y5V3	778 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	WIF1	Q9Y5W5	379 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	ASPM	Q8IZT6	3477 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	DSP	P15924	2871 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	PCSK5	Q92824	1860 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	ANKUB1	A6NFN9	424 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	CPSF4L	A6NMK7	179 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	MASP2	O00187	686 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	OIP5	O43482	229 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	CDC40	O60508	579 aa	Known RBP eCLIP	11.62	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	ACADS	P16219	412 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	FUT4	P22083	530 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	PRKACG	P22612	351 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	ITGA3	P26006	1051 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	ITPKB	P27987	946 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	HTR3A	P46098	478 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	RPS6KA3	P51812	740 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	RAD23A	P54725	363 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	CTBP2	P56545	445 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	CDC20	Q12834	499 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	PPP1R8	Q12972	351 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	CBFB	Q13951	182 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	SEC23B	Q15437	767 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	OTUD3	Q5T2D3	398 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	AGAP7P	Q5VUJ5	663 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TRAF4-208	ENST00000469529	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55

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