RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468468.5

TSPAN4-211, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN4, Length 2,777 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-211ENST00000468468 AKR7A2O43488 359 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 HTR2AP28223 471 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 ATP12AP54707 1039 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 OR1Q1Q15612 314 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 TMEM196Q5HYL7 178 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 AMIGO1Q86WK6 493 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 OR2L13Q8N349 312 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 SAMD12Q8N8I0 201 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 TMEM239Q8WW34 195 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.077e-7■■■■□ 20.3
TSPAN4-211ENST00000468468 RFT1Q96AA3 541 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 A0A1W2PQU0 124 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 DNAJB6O75190 326 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 F8A1P23610 371 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 EVI2BP34910 448 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 OR51V1Q9H2C8 321 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 KCMF1Q9P0J7 381 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 RASD1Q9Y272 281 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 H3BUI4 141 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 KCNJ13O60928 360 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 OR2B3O76000 313 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 TFPIP10646 304 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 NAGAP17050 411 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 SLC6A1P30531 599 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 IGFALSP35858 605 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 OR10A3P58181 314 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 RPS21P63220 83 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 SLC3A1Q07837 685 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 DEFB134Q4QY38 66 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 LNX2Q8N448 690 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 PTP4A1Q93096 173 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 IFT27Q9BW83 186 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 SLC17A9Q9BYT1 436 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 S1PR5Q9H228 398 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 CLDND1Q9NY35 253 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 FAM86C2PA6NEL3 165 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 NPIPA7E9PJI5 369 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 MT-ND5P03915 603 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 THBS1P07996 1170 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 NPIPA8P0DM63 369 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 THBS2P35442 1172 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 E2F1Q01094 437 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 FOXK2Q01167 660 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 ID2Q02363 134 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 FCRLBQ6BAA4 426 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 THSD4Q6ZMP0 1018 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 CEACAM19Q7Z692 300 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 SNAPC3Q92966 411 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 TEAD3Q99594 435 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 NDC1Q9BTX1 674 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 APOOQ9BUR5 198 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 ADAP2Q9NPF8 381 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 RCBTB2O95199 551 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 SLC35G6P0C7Q6 338 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 COL9A1P20849 921 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 PTGS2P35354 604 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 RFX3P48380 749 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 PITPNBP48739 271 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 RUNX2Q13950 521 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 BICRALQ6AI39 1079 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 SFXN4Q6P4A7 337 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 GPR135Q8IZ08 494 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 ZNF619Q8N2I2 560 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 ABCG5Q9H222 651 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 PIGUQ9H490 435 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 FBXO34Q9NWN3 711 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 J3QLW9 94 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 PEX12O00623 359 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 EML2O95834 649 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 ZNF19P17023 458 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 ACSL1P33121 698 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 OAFQ86UD1 273 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 CDK20Q8IZL9 346 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 OR13C2Q8NGS9 318 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 ABHD4Q8TB40 342 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 ZNF350Q9GZX5 532 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 C12orf10Q9HB07 376 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 CMC2Q9NRP2 79 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.1 ms