RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467983.1

ABCB4-208, Transcript of ATP binding cassette subfamily B member 4, human

TSL 3

Gene ABCB4, Length 414 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCB4-208	ENST00000467983	BPIFA1	Q9NP55	256 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	ISYNA1	Q9NPH2	558 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	RBFOX1	Q9NWB1	397 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	TXNL4B	Q9NX01	149 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	PTTG3P	Q9NZH4	202 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	MAT2B	Q9NZL9	334 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	IL17C	Q9P0M4	197 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	ZNF282	Q9UDV7	671 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	RAB23	Q9ULC3	237 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	RPL36	Q9Y3U8	105 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	HSPB11	Q9Y547	144 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	ASB4	Q9Y574	426 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	KCNE2	Q9Y6J6	123 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	IRGM	A1A4Y4	181 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	C1orf226	A1L170	272 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	WASHC1	A8K0Z3	465 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	SGK494	L7N484	410 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	BTN3A3	O00478	584 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	SCAMP2	O15127	329 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	LYRM1	O43325	122 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	NBN	O60934	754 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	ENTPD6	O75354	484 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	TSPAN9	O75954	239 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	B3GAT3	O94766	335 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	TPPP	O94811	219 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	AP2A2	O94973	939 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	GADD45G	O95257	159 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	RAB36	O95755	333 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	TRBC1	P01850	177 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	C1QC	P02747	245 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	C8G	P07360	202 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	FH	P07954	510 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	RHOC	P08134	193 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	ITGA5	P08648	1049 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	CKMT1A	P12532	417 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	IFI30	P13284	250 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	HLA-E	P13747	358 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	HSD3B1	P14060	373 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	ARSB	P15848	533 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	NAGA	P17050	411 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	EPOR	P19235	508 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	TNNI3	P19429	210 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	HLA-F	P30511	346 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	XCR1	P46094	333 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	CRYBA2	P53672	197 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	CDH4	P55283	916 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	SLC37A1	P57057	533 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	SNRPD2	P62316	118 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	MXD1	Q05195	221 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	EGR4	Q05215	589 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	RGS1	Q08116	209 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	BAMBI	Q13145	260 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	SCARB2	Q14108	478 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	COL28A1	Q2UY09	1125 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	GPRC6A	Q5T6X5	926 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	CPTP	Q5TA50	214 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	C12orf73	Q69YU5	71 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	FRMPD2B	Q6IN97	320 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	NCEH1	Q6PIU2	408 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	CD300LG	Q6UXG3	332 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	PAMR1	Q6UXH9	720 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	MACC1	Q6ZN28	852 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983		Q6ZTC4	211 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	CAMKMT	Q7Z624	323 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	TMC8	Q8IU68	726 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	BBS7	Q8IWZ6	715 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	PHC2	Q8IXK0	858 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	ADGRF3	Q8IZF5	1079 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	TAGAP	Q8N103	731 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	GHDC	Q8N2G8	530 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	C9orf62	Q8N4C0	152 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	ZNF557	Q8N988	423 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	L3MBTL4	Q8NA19	623 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	AQP11	Q8NBQ7	271 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	HJURP	Q8NCD3	748 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	OR4A15	Q8NGL6	344 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	OR52J3	Q8NH60	311 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	FBXO32	Q969P5	355 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	METTL2A	Q96IZ6	378 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	KCTD7	Q96MP8	289 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	QRFPR	Q96P65	431 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	SMIM14	Q96QK8	99 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	COPS8	Q99627	209 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCB4-208	ENST00000467983	PIP5K1A	Q99755	562 aa		4.55	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.9 ms