RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000413099.6

WDR48-202, Transcript of WD repeat domain 48, humanhuman

TSL 2

Gene WDR48, Length 2,300 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR48-202ENST00000413099 OR4C3Q8NH37 302 aa5.69□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 ZNF563Q8TA94 476 aa5.69□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 SLC38A4Q969I6 547 aa5.69□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 YIPF4Q9BSR8 244 aa5.69□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 TMEM43Q9BTV4 400 aa5.69□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 SFXN3Q9BWM7 321 aa5.69□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 ADAM19Q9H013 955 aa5.69□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 FAM107BQ9H098 131 aa5.69□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 ANKRD10Q9NXR5 420 aa5.69□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 H0Y3Z8 333 aa5.69□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 ADAMDEC1O15204 470 aa5.69□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 OR5F1O95221 314 aa5.69□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 MT-ATP6P00846 226 aa5.69□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 MST1P26927 711 aa5.69□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 OPRM1P35372 400 aa5.69□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 B3GALT5-AS1P59052 145 aa5.69□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 MXRA7P84157 204 aa5.69□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 COX20Q5RI15 118 aa5.69□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 RAET1LQ5VY80 246 aa5.69□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 ULK3Q6PHR2 472 aa5.69□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa5.69□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 ZNF836Q6ZNA1 936 aa5.69□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa5.69□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa5.69□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 PTOV1Q86YD1 416 aa5.69□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa5.69□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 OR5M3Q8NGP4 307 aa5.69□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 NFKBIDQ8NI38 313 aa5.69□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 PIGXQ8TBF5 258 aa5.69□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 RAB8BQ92930 207 aa5.69□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 WDYHV1Q96HA8 205 aa5.69□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 KLHL15Q96M94 604 aa5.69□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 CFAP54Q96N23 3096 aa5.69□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 DMRTA2Q96SC8 542 aa5.69□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 ZNF347Q96SE7 839 aa5.69□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 UGT2B28Q9BY64 529 aa5.69□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 ANKRA2Q9H9E1 313 aa5.69□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 EMC3Q9P0I2 261 aa5.69□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 ACAD8Q9UKU7 415 aa5.69□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 MKLN1Q9UL63 735 aa5.69□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 NTNG1Q9Y2I2 539 aa5.69□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 MEMO1Q9Y316 297 aa5.69□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 CSAG2Q9Y5P2 127 aa5.69□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 CORINQ9Y5Q5 1042 aa5.69□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 SNX13Q9Y5W8 968 aa5.69□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa5.69□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 DCHS1Q96JQ0 3298 aa5.68□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 NCOR2Q9Y618 2525 aa5.68□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 PINLYPA6NC86 204 aa5.68□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 CCT8L1PA6NM43 557 aa5.68□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 CENPBD1B2RD01 187 aa5.68□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 GPR171O14626 319 aa5.68□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 AIM2O14862 343 aa5.68□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 ZIC3O60481 467 aa5.68□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 NUDT14O95848 222 aa5.68□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 NR2C1P13056 603 aa5.68□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 BMP7P18075 431 aa5.68□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 GGT1P19440 569 aa5.68□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 IL11P20809 199 aa5.68□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 CHRNB4P30926 498 aa5.68□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 KDELR2P33947 212 aa5.68□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 LHX2P50458 406 aa5.68□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 GPR85P60893 370 aa5.68□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 SELENOWP63302 87 aa5.68□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 SLC35A1P78382 337 aa5.68□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 LIPEQ05469 1076 aa5.68□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 QPRTQ15274 297 aa5.68□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 TOMM20Q15388 145 aa5.68□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 ADRM1Q16186 407 aa5.68□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa5.68□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 CBLL1Q75N03 491 aa5.68□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 SLC15A3Q8IY34 581 aa5.68□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 ULK2Q8IYT8 1036 aa5.68□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 SCAIQ8N9R8 606 aa5.68□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 SIMC1Q8NDZ2 872 aa5.68□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 OR10A6Q8NH74 314 aa5.68□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 OR2V1Q8NHB1 315 aa5.68□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 RND1Q92730 232 aa5.68□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 MCUR1Q96AQ8 359 aa5.68□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 ZNF583Q96ND8 569 aa5.68□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 TIMP4Q99727 224 aa5.68□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 HES7Q9BYE0 225 aa5.68□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 ACTR3BQ9P1U1 418 aa5.68□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 CHRNA9Q9UGM1 479 aa5.68□□□□□ -1.5
WDR48-202ENST00000413099 BOLA1Q9Y3E2 137 aa5.68□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms