RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 ANGPT2O15123 496 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 OIP5O43482 229 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC22O60826 627 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 SCN2BO60939 215 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 ANP32DO95626 131 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 LINGO3P0C6S8 592 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 EPXP11678 715 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 MATN1P21941 496 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 ELK4P28324 431 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 EIF1P41567 113 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 KHKP50053 298 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 P2RX1P51575 399 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 CCR4P51679 360 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 ATP12AP54707 1039 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 NME5P56597 212 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 UFM1P61960 85 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 SIRPAP78324 504 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 HPCAP84074 193 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 FOXF1Q12946 379 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 GNA13Q14344 377 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 FGFBP1Q14512 234 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 SGCBQ16585 318 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 NDUFAF6Q330K2 333 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 KLHL26Q53HC5 615 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 PDZK1Q5T2W1 519 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 CBLN3Q6UW01 205 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 C16orf62Q7Z3J2 963 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 CPLX4Q7Z7G2 160 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 OR10D3Q8NH80 312 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 LINC01560Q8TB33 94 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 MIPOL1Q8TD10 442 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 STARD4Q96DR4 205 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 NEURL3Q96EH8 262 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 ADGRG7Q96K78 797 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 SDF2Q99470 211 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 NMUR2Q9GZQ4 415 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 OR51I1Q9H343 314 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 RASSF1Q9NS23 344 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 CORO2BQ9UQ03 480 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 CARD8Q9Y2G2 431 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 DTNAQ9Y4J8 743 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 MED13LQ71F56 2210 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 FAM221AA4D161 298 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 SH3D21A4FU49 640 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 GMNCA6NCL1 334 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 A8MXE2 369 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 C9JVG2 144 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 TNFSF11O14788 317 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 ADAMDEC1O15204 470 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF264O43296 627 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 CXCL13O43927 109 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 KIAA0513O60268 411 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 FCMRO60667 390 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 STX11O75558 287 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 AQP8O94778 261 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 SYNGR4O95473 234 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 PLGP00747 810 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 OPN1LWP04000 364 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 GUSBP08236 651 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 ZCCHC18P0CG32 403 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 UBL4AP11441 157 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 IL11P20809 199 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 LSP1P33241 339 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 SFTPDP35247 375 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 SLC6A8P48029 635 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 CASP9P55211 416 aa6.87□□□□□ -1.31
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SGMS1-201ENST00000361543 PHC1P78364 1004 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 FUT5Q11128 374 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 SKP2Q13309 424 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 GUSBP1Q15486 140 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 TESK1Q15569 626 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 GPR68Q15743 365 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 TIGD2Q4W5G0 525 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 COQ5Q5HYK3 327 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 C6orf10Q5SRN2 563 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 FBXW10Q5XX13 1052 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 SAXO2Q658L1 398 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 HBMQ6B0K9 141 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF621Q6ZSS3 439 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 OLIG3Q7RTU3 272 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 BTLAQ7Z6A9 289 aa6.87□□□□□ -1.31
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