RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358813.4

CCL20-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 800 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-201ENST00000358813 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
CCL20-201ENST00000358813 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
CCL20-201ENST00000358813 RAB20Q9NX57 234 aa4.88□□□□□ -1.63
CCL20-201ENST00000358813 PLEK2Q9NYT0 353 aa4.88□□□□□ -1.63
CCL20-201ENST00000358813 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
CCL20-201ENST00000358813 PILRAQ9UKJ1 303 aa4.88□□□□□ -1.63
CCL20-201ENST00000358813 MYO6Q9UM54 1294 aa4.88□□□□□ -1.63
CCL20-201ENST00000358813 BPTFQ12830 3046 aa4.88□□□□□ -1.63
CCL20-201ENST00000358813 MYLKQ15746 1914 aa4.87□□□□□ -1.63
CCL20-201ENST00000358813 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
CCL20-201ENST00000358813 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa4.87□□□□□ -1.63
CCL20-201ENST00000358813 ZNF732B4DXR9 585 aa4.87□□□□□ -1.63
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CCL20-201ENST00000358813 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
CCL20-201ENST00000358813 RAD1O60671 282 aa4.87□□□□□ -1.63
CCL20-201ENST00000358813 LRCH4O75427 683 aa4.87□□□□□ -1.63
CCL20-201ENST00000358813 CDH1P12830 882 aa4.87□□□□□ -1.63
CCL20-201ENST00000358813 PCYT1AP49585 367 aa4.87□□□□□ -1.63
CCL20-201ENST00000358813 CCR4P51679 360 aa4.87□□□□□ -1.63
CCL20-201ENST00000358813 HERV-K104P61576 105 aa4.87□□□□□ -1.63
CCL20-201ENST00000358813 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
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CCL20-201ENST00000358813 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
CCL20-201ENST00000358813 GPR50Q13585 617 aa4.87□□□□□ -1.63
CCL20-201ENST00000358813 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
CCL20-201ENST00000358813 DEFB109BQ30KR1 87 aa4.87□□□□□ -1.63
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CCL20-201ENST00000358813 C22orf39Q6P5X5 142 aa4.87□□□□□ -1.63
CCL20-201ENST00000358813 TAS2R42Q7RTR8 314 aa4.87□□□□□ -1.63
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CCL20-201ENST00000358813 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa4.87□□□□□ -1.63
CCL20-201ENST00000358813 OR7A2PQ8NGA2 310 aa4.87□□□□□ -1.63
CCL20-201ENST00000358813 OR4L1Q8NH43 312 aa4.87□□□□□ -1.63
CCL20-201ENST00000358813 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
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CCL20-201ENST00000358813 BPIFA2Q96DR5 249 aa4.87□□□□□ -1.63
CCL20-201ENST00000358813 HSFY1Q96LI6 401 aa4.87□□□□□ -1.63
CCL20-201ENST00000358813 C4orf45Q96LM5 186 aa4.87□□□□□ -1.63
CCL20-201ENST00000358813 CCM2Q9BSQ5 444 aa4.87□□□□□ -1.63
CCL20-201ENST00000358813 OR2B2Q9GZK3 357 aa4.87□□□□□ -1.63
CCL20-201ENST00000358813 POPDC2Q9HBU9 364 aa4.87□□□□□ -1.63
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CCL20-201ENST00000358813 DDIT4Q9NX09 232 aa4.87□□□□□ -1.63
CCL20-201ENST00000358813 SLC39A1Q9NY26 324 aa4.87□□□□□ -1.63
CCL20-201ENST00000358813 FBXL4Q9UKA2 621 aa4.87□□□□□ -1.63
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CCL20-201ENST00000358813 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
CCL20-201ENST00000358813 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa4.87□□□□□ -1.63
CCL20-201ENST00000358813 RNF215Q9Y6U7 377 aa4.87□□□□□ -1.63
CCL20-201ENST00000358813 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
CCL20-201ENST00000358813 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa4.87□□□□□ -1.63
CCL20-201ENST00000358813 NUMA1Q14980 2115 aa4.87□□□□□ -1.63
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CCL20-201ENST00000358813 XKRY2A2RUG3 117 aa4.86□□□□□ -1.63
CCL20-201ENST00000358813 IGLON5A6NGN9 336 aa4.86□□□□□ -1.63
CCL20-201ENST00000358813 H0Y8G0 127 aa4.86□□□□□ -1.63
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CCL20-201ENST00000358813 ACKR3P25106 362 aa4.86□□□□□ -1.63
CCL20-201ENST00000358813 OR1E1P30953 314 aa4.86□□□□□ -1.63
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CCL20-201ENST00000358813 SLC1A6P48664 564 aa4.86□□□□□ -1.63
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CCL20-201ENST00000358813 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa4.86□□□□□ -1.63
CCL20-201ENST00000358813 CEACAM20Q6UY09 585 aa4.86□□□□□ -1.63
CCL20-201ENST00000358813 TMEM64Q6YI46 380 aa4.86□□□□□ -1.63
CCL20-201ENST00000358813 C17orf107Q6ZR85 190 aa4.86□□□□□ -1.63
CCL20-201ENST00000358813 ERASQ7Z444 233 aa4.86□□□□□ -1.63
CCL20-201ENST00000358813 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
CCL20-201ENST00000358813 TAC4Q86UU9 113 aa4.86□□□□□ -1.63
CCL20-201ENST00000358813 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa4.86□□□□□ -1.63
CCL20-201ENST00000358813 DCAF4L2Q8NA75 395 aa4.86□□□□□ -1.63
CCL20-201ENST00000358813 OR13C5Q8NGS8 318 aa4.86□□□□□ -1.63
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