RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335475.5

KCNQ1-202, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 2,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-202ENST00000335475 SOX30O94993 753 aa19.15■□□□□ 0.66
KCNQ1-202ENST00000335475 SAGP10523 405 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
KCNQ1-202ENST00000335475 RNH1P13489 461 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
KCNQ1-202ENST00000335475 PAICSP22234 425 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
KCNQ1-202ENST00000335475 BLKP51451 505 aa19.15■□□□□ 0.66
KCNQ1-202ENST00000335475 CAMKK1Q8N5S9 505 aa19.15■□□□□ 0.66
KCNQ1-202ENST00000335475 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
KCNQ1-202ENST00000335475 NACC2Q96BF6 587 aa19.15■□□□□ 0.66
KCNQ1-202ENST00000335475 KLHDC7BQ96G42 594 aa19.15■□□□□ 0.66
KCNQ1-202ENST00000335475 PEX11GQ96HA9 241 aa19.15■□□□□ 0.66
KCNQ1-202ENST00000335475 DIRAS2Q96HU8 199 aa19.15■□□□□ 0.66
KCNQ1-202ENST00000335475 IFT27Q9BW83 186 aa19.15■□□□□ 0.66
KCNQ1-202ENST00000335475 KNL1Q8NG31 2342 aa19.15■□□□□ 0.66
KCNQ1-202ENST00000335475 FAM86C2PA6NEL3 165 aa19.15■□□□□ 0.66
KCNQ1-202ENST00000335475 TMEM221A6NGB7 291 aa19.15■□□□□ 0.66
KCNQ1-202ENST00000335475 DVL2O14641 736 aa19.15■□□□□ 0.66
KCNQ1-202ENST00000335475 CASKO14936 926 aa19.15■□□□□ 0.66
KCNQ1-202ENST00000335475 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
KCNQ1-202ENST00000335475 SEC14L5O43304 696 aa19.15■□□□□ 0.66
KCNQ1-202ENST00000335475 HCN1O60741 890 aa19.15■□□□□ 0.66
KCNQ1-202ENST00000335475 CSF3P09919 207 aa19.15■□□□□ 0.66
KCNQ1-202ENST00000335475 GALP22466 123 aa19.15■□□□□ 0.66
KCNQ1-202ENST00000335475 NOS3P29474 1203 aa19.15■□□□□ 0.66
KCNQ1-202ENST00000335475 GPR50Q13585 617 aa19.15■□□□□ 0.66
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF141Q15928 474 aa19.15■□□□□ 0.66
KCNQ1-202ENST00000335475 CDK20Q8IZL9 346 aa19.15■□□□□ 0.66
KCNQ1-202ENST00000335475 LSMEM1Q8N8F7 131 aa19.15■□□□□ 0.66
KCNQ1-202ENST00000335475 NEIL3Q8TAT5 605 aa19.15■□□□□ 0.66
KCNQ1-202ENST00000335475 RIT1Q92963 219 aa19.15■□□□□ 0.66
KCNQ1-202ENST00000335475 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
KCNQ1-202ENST00000335475 FABP12A6NFH5 140 aa19.14■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 RBM34P42696 430 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 GABRA4P48169 554 aa19.14■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 FGFBP1Q14512 234 aa19.14■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP19.14■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP19.14■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 GDPD1Q8N9F7 314 aa19.14■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 MSANTD3Q96H12 275 aa19.14■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 MAP3K3Q99759 626 aa19.14■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 ATF6BQ99941 703 aa19.14■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 SOSTQ9BQB4 213 aa19.14■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 RNF32Q9H0A6 362 aa19.14■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 MCCC2Q9HCC0 563 aa19.14■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa19.14■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 CD8B2A6NJW9 211 aa19.13■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 SLC22A31A6NKX4 558 aa19.13■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 RNF13O43567 381 aa19.13■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 CTNSO60931 367 aa19.13■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 PPP1R3DO95685 299 aa19.13■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 CD8BP10966 210 aa19.13■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 NUDT1P36639 197 aa19.13■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 CAPZBP47756 277 aa19.13■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 LINC00114Q6XXX2 140 aa19.13■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 OR51A7Q8NH64 312 aa19.13■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 SPACA7Q96KW9 195 aa19.13■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF285Q96NJ3 590 aa19.13■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 TRIM2Q9C040 744 aa19.13■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 NCR1O76036 304 aa19.13■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 GPR3P46089 330 aa19.13■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 FASLGP48023 281 aa19.13■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 PPP3R1P63098 170 aa19.13■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 ASAH1Q13510 395 aa19.13■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 CRMP1Q14194 572 aa19.13■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 GALEQ14376 348 aa19.13■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 KLHL12Q53G59 568 aa19.13■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 AGAP6Q5VW22 663 aa19.13■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 FCRLBQ6BAA4 426 aa19.13■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 RCBTB1Q8NDN9 531 aa19.13■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 RLN3Q8WXF3 142 aa19.13■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 SLC35B4Q969S0 331 aa19.13■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 AGAP4Q96P64 663 aa19.13■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 TBX5Q99593 518 aa19.13■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 INPP5EQ9NRR6 644 aa19.13■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 BABAM2Q9NXR7 383 aa19.13■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 MTCH2Q9Y6C9 303 aa19.13■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa19.12■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 DYRK3O43781 588 aa19.12■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 REM1O75628 298 aa19.12■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 WNT1P04628 370 aa19.12■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 ALG10BQ5I7T1 473 aa19.12■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF595Q8IYB9 648 aa19.12■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 ARL14Q8N4G2 192 aa19.12■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 TEAD3Q99594 435 aa19.12■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 ADGRL4Q9HBW9 690 aa19.12■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa19.12■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP19.12■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa19.12■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 BAIAP2Q9UQB8 552 aa19.12■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa19.12■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP19.12■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 NSA2O95478 260 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 CT45A8P0DMV1 189 aa19.12■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 CT45A9P0DMV2 189 aa19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms