RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317868.8

ATG4C-201, Transcript of autophagy related 4C cysteine peptidase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ATG4C, Length 2,938 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4C-201ENST00000317868 OR52R1Q8NGF1 315 aa12.74□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 GDF15Q99988 308 aa12.74□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 GSDMCQ9BYG8 508 aa12.74□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 TBC1D17Q9HA65 648 aa12.74□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 FAM60AQ9NP50 221 aa12.74□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa12.74□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 BAIAP2Q9UQB8 552 aa12.74□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa12.73□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa12.73□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 COQ9O75208 318 aa12.73□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 SEMA4FO95754 770 aa12.73□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 BMP7P18075 431 aa12.73□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 BMP8BP34820 402 aa12.73□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 EMDP50402 254 aa12.73□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 CCINQ13939 588 aa12.73□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa12.73□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 TEAD3Q99594 435 aa12.73□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 NEK6Q9HC98 313 aa12.73□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa12.73□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa12.73□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 HMX3A6NHT5 357 aa12.73□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 CD8B2A6NJW9 211 aa12.73□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 A8MU76 341 aa12.73□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 SGK494L7N484 410 aa12.73□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 TMCC2O75069 709 aa12.73□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 NCR1O76036 304 aa12.73□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 CTSBP07858 339 aa12.73□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 CD8BP10966 210 aa12.73□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 APEX1P27695 318 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 THBS2P35442 1172 aa12.73□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 LTBRP36941 435 aa12.73□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 NR4A2P43354 598 aa12.73□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 KIR2DL3P43628 341 aa12.73□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 CCR5P51681 352 aa12.73□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 ZNF85Q03923 595 aa12.73□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 P2RY14Q15391 338 aa12.73□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 TAB1Q15750 504 aa12.73□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 ZNF141Q15928 474 aa12.73□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 PRTGQ2VWP7 1150 aa12.73□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 PDZK1Q5T2W1 519 aa12.73□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 B3GLCTQ6Y288 498 aa12.73□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 SLC2A12Q8TD20 617 aa12.73□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 VSTM2LQ96N03 204 aa12.73□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 SEMA6CQ9H3T2 930 aa12.73□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 FOLH1BQ9HBA9 442 aa12.73□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 MCCC2Q9HCC0 563 aa12.73□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 SERTAD3Q9UJW9 196 aa12.73□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 ZNF221Q9UK13 617 aa12.73□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa12.72□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 PAICSP22234 425 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 HOXD12P35452 270 aa12.72□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 FGFBP1Q14512 234 aa12.72□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 RAB30Q15771 203 aa12.72□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 PXKQ7Z7A4 578 aa12.72□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa12.72□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 ACOT12Q8WYK0 555 aa12.72□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 LRFN5Q96NI6 719 aa12.72□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 COMMD3Q9UBI1 195 aa12.72□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 MPDZO75970 2070 aa12.72□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 A0A1B0GWA3 101 aa12.72□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 FAM86C2PA6NEL3 165 aa12.72□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 RDH16O75452 317 aa12.72□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 SBK2P0C263 348 aa12.72□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 ST6GAL1P15907 406 aa12.72□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 NOS3P29474 1203 aa12.72□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 FZD2Q14332 565 aa12.72□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 ZNF438Q7Z4V0 828 aa12.72□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 DUSP18Q8NEJ0 188 aa12.72□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 PGLYRP3Q96LB9 341 aa12.72□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 MMP28Q9H239 520 aa12.72□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 KCNN2Q9H2S1 579 aa12.72□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 MSRAQ9UJ68 235 aa12.72□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa12.72□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa12.72□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 PYDC2Q56P42 97 aa12.72□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 OOSP2Q86WS3 158 aa12.72□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 PHOX2BQ99453 314 aa12.72□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 ORAI3Q9BRQ5 295 aa12.72□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 TMEM43Q9BTV4 400 aa12.72□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 SLC28A3Q9HAS3 691 aa12.72□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 TMEM27Q9HBJ8 222 aa12.72□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 TRIM36Q9NQ86 728 aa12.72□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 STARD5Q9NSY2 213 aa12.72□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 TRAV27A0A087WT01 109 aa12.71□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 A0A0G2JK05 382 aa12.71□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 SLC19A2O60779 497 aa12.71□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 GSTT2P0CG29 244 aa12.71□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 GSTT2BP0CG30 244 aa12.71□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 GGTLC2Q14390 218 aa12.71□□□□□ -0.37
ATG4C-201ENST00000317868 TRAM1Q15629 374 aa12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.6 ms