RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311626.8

HOXB3-201, Transcript of homeobox B3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 2,642 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-201ENST00000311626 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
HOXB3-201ENST00000311626 POLHQ9Y253 713 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXB3-201ENST00000311626 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
HOXB3-201ENST00000311626 H0YGG7 62 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXB3-201ENST00000311626 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
HOXB3-201ENST00000311626 SMIM10L1P0DMW3 83 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXB3-201ENST00000311626 SRP9P49458 86 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
HOXB3-201ENST00000311626 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
HOXB3-201ENST00000311626 PPP1CAP62136 330 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXB3-201ENST00000311626 GPR18Q14330 331 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXB3-201ENST00000311626 TMEM44Q2T9K0 475 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXB3-201ENST00000311626 USP53Q70EK8 1073 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXB3-201ENST00000311626 GID4Q8IVV7 300 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXB3-201ENST00000311626 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXB3-201ENST00000311626 FAM3CQ92520 227 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXB3-201ENST00000311626 TM4SF19Q96DZ7 209 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXB3-201ENST00000311626 SMIM10Q96HG1 83 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXB3-201ENST00000311626 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXB3-201ENST00000311626 SPTBP11277 2137 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXB3-201ENST00000311626 HCRTR1O43613 425 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXB3-201ENST00000311626 NID1P14543 1247 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXB3-201ENST00000311626 ARFIP1P53367 373 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXB3-201ENST00000311626 TRILQ7L0X0 811 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXB3-201ENST00000311626 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXB3-201ENST00000311626 OBP2AQ9NY56 170 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXB3-201ENST00000311626 CDHR4A6H8M9 788 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 PBX2P40425 430 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 EIPR1Q53HC9 387 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 BMPERQ8N8U9 685 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 OR5J2Q8NH18 312 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 ACTR10Q9NZ32 417 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 MAU2Q9Y6X3 613 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 A0A1W2PRG6 482 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 ZNF24P17028 368 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 HLA-DMAP28067 261 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 ADAM15Q13444 863 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 GPR176Q14439 515 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 ZNF542PQ5EBM4 170 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 NUDT18Q6ZVK8 323 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 GPR135Q8IZ08 494 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 OR4N2Q8NGD1 307 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 BMFQ96LC9 184 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 COQ7Q99807 217 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 SIGLEC7Q9Y286 467 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 AGR2O95994 175 aa23.44■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 DBIP07108 87 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 ACSL1P33121 698 aa23.44■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 EVI2BP34910 448 aa23.44■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 GALEQ14376 348 aa23.44■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 LNX2Q8N448 690 aa23.44■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 DUSP18Q8NEJ0 188 aa23.44■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 KCNJ15Q99712 375 aa23.44■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 A0A1W2PQF6 199 aa23.44■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 KCNJ13O60928 360 aa23.44■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
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HOXB3-201ENST00000311626 MTFR2Q6P444 385 aa23.44■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 TRIM36Q9NQ86 728 aa23.44■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 FLRT3Q9NZU0 649 aa23.44■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 SGK494L7N484 410 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 NGFRP08138 427 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 HOXB2P14652 356 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 PYCR1P32322 319 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 EMDP50402 254 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 ZNF85Q03923 595 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 YIF1BQ5BJH7 314 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 ABHD4Q8TB40 342 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 TMEM106CQ9BVX2 250 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 PILRAQ9UKJ1 303 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 SPEGQ15772 3267 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 FAM86C2PA6NEL3 165 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 OR2W5A6NFC9 320 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 LRRN3E7EW58 273 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 SCO2O43819 266 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 THBS1P07996 1170 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 ARSBP15848 533 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 NTSR1P30989 418 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 BMP8BP34820 402 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 THBS2P35442 1172 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 DEFB110Q30KQ9 67 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 AMZ1Q400G9 498 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 C9orf50Q5SZB4 431 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 KRT74Q7RTS7 529 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 SMPDL3BQ92485 455 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 LRRN3Q9H3W5 708 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 FN3KQ9H479 309 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 CMC2Q9NRP2 79 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 MED31Q9Y3C7 131 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 IMPA2O14732 288 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXB3-201ENST00000311626 MTNR1BP49286 362 aa23.42■■□□□ 1.34
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