RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000302313.9

WDR48-201, Transcript of WD repeat domain 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene WDR48, Length 3,707 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR48-201ENST00000302313 GHRLQ9UBU3 117 aa6.7□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 TTLL8A6PVC2 850 aa6.69□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 STX11O75558 287 aa6.69□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 TYRP14679 529 aa6.69□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 RAC2P15153 192 aa6.69□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 IMPA1P29218 277 aa6.69□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 GABRA5P31644 462 aa6.69□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 MAS1LP35410 378 aa6.69□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 FRKP42685 505 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 BDKRB1P46663 353 aa6.69□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 SMIM11AP58511 58 aa6.69□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 RAB40BQ12829 278 aa6.69□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 CHAF1BQ13112 559 aa6.69□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 PRSS53Q2L4Q9 553 aa6.69□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 ENTPD8Q5MY95 495 aa6.69□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 TCTN3Q6NUS6 607 aa6.69□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 MED27Q6P2C8 311 aa6.69□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa6.69□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa6.69□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa6.69□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 ZNF454Q8N9F8 522 aa6.69□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 DIRAS2Q96HU8 199 aa6.69□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 SLC22A12Q96S37 553 aa6.69□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 ATF6BQ99941 703 aa6.69□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 TM6SF2Q9BZW4 377 aa6.69□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa6.69□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 ACKR4Q9NPB9 350 aa6.69□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa6.69□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 SLC5A10A0PJK1 596 aa6.69□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 SDC3O75056 442 aa6.69□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 HEXBP07686 556 aa6.69□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 CPN1P15169 458 aa6.69□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 ZNF44P15621 663 aa6.69□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 DNASE1P24855 282 aa6.69□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 KIAA1024LP59773 190 aa6.69□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 RPS13P62277 151 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 ST3GAL2Q16842 350 aa6.69□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 SYT14P1Q58G82 188 aa6.69□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 LY6G5CQ5SRR4 150 aa6.69□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 THEM4Q5T1C6 240 aa6.69□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 AVPI1Q5T686 147 aa6.69□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 LILRA6Q6PI73 481 aa6.69□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 MTSS1LQ765P7 747 aa6.69□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 TMEM150AQ86TG1 271 aa6.69□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 PEX11GQ96HA9 241 aa6.69□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 DMRT3Q9NQL9 472 aa6.69□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 HS3ST2Q9Y278 367 aa6.69□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa6.69□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 CKAP5Q14008 2032 aa6.69□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 GON4LQ3T8J9 2241 aa6.69□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 OR6C68A6NDL8 312 aa6.68□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 MARCH11A6NNE9 402 aa6.68□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 UBXN7O94888 489 aa6.68□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 ACP2P11117 423 aa6.68□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 ETV5P41161 510 aa6.68□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 PCP4P48539 62 aa6.68□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 PGDP52209 483 aa6.68□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 SLC3A1Q07837 685 aa6.68□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 GANABQ14697 944 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 DCST1Q5T197 706 aa6.68□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 LIPKQ5VXJ0 399 aa6.68□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 COMMD6Q7Z4G1 85 aa6.68□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 FIBINQ8TAL6 211 aa6.68□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 RXFP4Q8TDU9 374 aa6.68□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 PPCDCQ96CD2 204 aa6.68□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa6.68□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 EFCAB11Q9BUY7 163 aa6.68□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 SGPP1Q9BX95 441 aa6.68□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 FAM117AQ9C073 453 aa6.68□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 SUV39H2Q9H5I1 410 aa6.68□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa6.68□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 CBLCQ9ULV8 474 aa6.68□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 SUSD5O60279 629 aa6.68□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 TSPAN19P0C672 248 aa6.68□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 OR8U8P0C7N1 319 aa6.68□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 RAB3BP20337 219 aa6.68□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 RAB4AP20338 218 aa6.68□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 MPGP29372 298 aa6.68□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 WASP42768 502 aa6.68□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 RFX3P48380 749 aa6.68□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 DGKGP49619 791 aa6.68□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 SELENOPP49908 381 aa6.68□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 CXADRP78310 365 aa6.68□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 IRF4Q15306 451 aa6.68□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 KRBOX4Q5JUW0 171 aa6.68□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 ADNP2Q6IQ32 1131 aa6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms